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NAC家族生物信息学分析
引用本文:邹嘉欣,吕楠,朱梦丽,朱乾坤,王万军. NAC家族生物信息学分析[J]. 生物技术通讯, 2015, 0(1): 68-73
作者姓名:邹嘉欣  吕楠  朱梦丽  朱乾坤  王万军
作者单位:西南交通大学生命科学与工程学院植物组织培养实验室
基金项目:国家自然科学基金(31271302)
摘    要:目的:探讨NAC基因结构和分布特点,了解NAC基因之间的进化关系。方法:从NCBI下载获得目标序列,通过染色体定位、比对、拼接得到新的mRNA,翻译为蛋白质,得到保守基序,再比对,绘制系统发育树进行分析。结果:生物信息学分析发现NAC家族基因在5个物种的基因组中都有分布;大多数NAC基因都有3个以上的外显子,绝大多数NAC基因仅1个NAM结构域,大多数NAM结构域都具有两端的保守基序,大多数NAM结构域位于2个相邻外显子上;NAC蛋白在单、双子叶植物分化上已有功能上的分歧。结论:NAC家族基因分布广,结构多为3个外显子,1个拥有两端保守基序的NAM结构域位于2个相邻外显子上。该研究为鉴定并获得NAC全长序列奠定了基础。

关 键 词:NAC  NAM结构域  生物信息学

Bioinformatics Analysis of NAC Family
ZOU Jia-Xin;Lü Nan;ZHU Meng-Li;ZHU Qian-Kun;WANG Wan-Jun. Bioinformatics Analysis of NAC Family[J]. Letters in Biotechnology, 2015, 0(1): 68-73
Authors:ZOU Jia-Xin  Lü Nan  ZHU Meng-Li  ZHU Qian-Kun  WANG Wan-Jun
Affiliation:ZOU Jia-Xin;Lü Nan;ZHU Meng-Li;ZHU Qian-Kun;WANG Wan-Jun;Laboratory of Plant Tissue Culture,School of Life Science and Engineering,Southwest Jiaotong University;
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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