| 油菜沪油15中AP2/ERF-B3亚族转录因子的克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 庄静,周熙荣,孙超才,管帮超,彭日荷,乔玉山,章镇,熊爱生,姚泉洪.油菜沪油15中AP2/ERF-B3亚族转录因子的克隆和生物信息学分析[J].分子细胞生物学报,2008,41(3):192-206. |
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| 作者姓名： | 庄静 周熙荣 孙超才 管帮超 彭日荷 乔玉山 章镇 熊爱生 姚泉洪 |
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| 作者单位： | [1]南京农业大学园艺学院,南京210095 [2]上海市农业科学院生物技术研究所,上海201106 [3]上海市农业科学院作物育种栽培研究所,上海201106 [4]上海市崇明县农业技术推广中心,上海202150 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)
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上海市科技启明星和优秀学科带头人计划 |
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| 摘 要： | AP2/ERF转录因子家族广泛存在于植物中,参与植物细胞周期、生长发育以及生物和非晌镄财认喙鼗虮泶锏骺?本文利用油菜UniGene数据库.以拟南芥AP2/ERF-B3亚族转录因子保守序列为信息探针,分离得到2个油菜AP2/ERF-B3亚族的转录因子BnaERFB3-1和BnaERFB3-2.通过PCR和RT-PCR方法分别从双低甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因.序列分析显示.克隆的BnaERFB3-1-Hv15和BnaERFB3-2-Hv15转录因子与电子克隆的基因序列差异很小,均只有1个氨基酸位点不同.且都没有内舍子.从氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构、无序化特性等方面进行了预测和较为全面的分析.结果显示BnaERFB3-1-Hv15和BnaERFB3-2-Hv15是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与AtERF5相似,BnaERFB3-1-Hv15和BnaERFB3-2-Hv15蛋白无序化程度大于拟南芥AtERF5.通过分析EST丰度显示,BnaERFB3-1的表达集中在种子中,而BnaERFB3-2的表达则集中在根中.另外.将上述基因分别构建入酵母表达载体和植物双元表达载体,为深入研究该基因在油菜抗逆调控中的作用奠定了基础.
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| 关 键 词： | 转录因子 AP2/RFF-B3亚族 生物信息学 进化树 油菜沪油15 油菜 沪油 转录因子 克隆 生物信息学分析 FACTOR ANALYZING CLONING 作用 调控 抗逆 研究 双元表达载体 酵母表达载体 种子 程度 相似 蛋白质 结果 预测 |
CLONING AND BIOINFORMATIC ANALYZING OFTRANSCRIPTION FACTOR AP2/ERF-B3 SUBFAMILY GENESFROM BRASSICA NAPUS L. HUYOU 15 |
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| ZHUANG Jing,ZHOU Xi Rong,SUN Chao Cai,GUAN Bang Chao,PENG Ri He,QIAO Yu Shan,ZHANG Zhen,XIONG Ai Sheng,YAO Quan Hong.CLONING AND BIOINFORMATIC ANALYZING OFTRANSCRIPTION FACTOR AP2/ERF-B3 SUBFAMILY GENESFROM BRASSICA NAPUS L. HUYOU 15[J].Journal of Molecular Cell Biology,2008,41(3):192-206. |
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| Authors: | ZHUANG Jing ZHOU Xi Rong SUN Chao Cai GUAN Bang Chao PENG Ri He QIAO Yu Shan ZHANG Zhen XIONG Ai Sheng YAO Quan Hong |
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| Institution: | College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China. |
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