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鲩肠袋虫18S rDNA的扩增、测序与分析
引用本文:李明,王崇,汪建国,喻达辉,王文博,戈贤平,徐跑,谢骏,龚小宁. 鲩肠袋虫18S rDNA的扩增、测序与分析[J]. 水生生物学报, 2011, 35(2): 203-209. DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00203
作者姓名:李明  王崇  汪建国  喻达辉  王文博  戈贤平  徐跑  谢骏  龚小宁
作者单位:1. 中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室,广州,510300;武汉工业学院,湖北省动物营养与饲料科学重点实验室,武汉,430023;中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072
2. 水利部中国科学院水工程生态研究所,武汉,430079
3. 中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072
4. 中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室,广州,510300
5. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部淡,水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,无锡,214081
基金项目:国家自然科学基金(30870275)、(31000947); 农业部海水养殖生态与质量控制重点实验室开放课题(2008C1201);农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点实验室开放课题(BZ2009-02); 淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题(2009FB08); 淮安市科技支撑计划(SN1087); 湖北省教育厅优秀中青年人才项目(Q20101702)资助
摘    要:研究测定了寄生于草鱼肠道的鲩肠袋虫的18S rDNA序列。鲩肠袋虫的18S rDNA基因序列包括1638个碱基。分别用3种分析方法(邻接法、最大简约法、贝叶斯法)构建了毛口亚纲的系统发育树,得到结果如下:均支持毛口亚纲为单系发生且内分前庭目、内毛目和澳大利亚枝3个类群(100%Bay、100%MP、100%NJ);均支持内毛目(100%Bay、98%MP、93%NJ)、澳大利亚枝(100%Bay、97%MP、99%NJ)的单系性和前庭目的并系性。3种构树方法都支持鲩肠袋虫与澳大利亚枝聚类(100%Bay、100%MP、100%NJ),而后与"内毛目+前庭目(部分)"构成姊妹群(100%Bay、85%MP、72%NJ);而结肠小袋纤毛虫与"澳大利亚枝+鲩肠袋虫"以及"内毛目+前庭目(部分)"分枝并列,共同构成毛口亚纲(100%Bay、100%MP、100%NJ)。这暗示了肠袋虫类群在系统发育上的并系性和其分类阶元的提升。

关 键 词:鲩肠袋虫  18S rDNA  系统发育

PCR AMPLIFICATION, SEQUENCING AND ANALYSIS OF 18S rDNA OF BALANTIDIUM CTENOPHARYNGODONI INHABITING GRASS CARP
LI Ming,WANG Chong,WANG Jian-Guo,YU Da-Hui,WANG Wen-Bo,GE Xian-Ping,XU Pao,XIE Jun,GONG Xiao-Ning. PCR AMPLIFICATION, SEQUENCING AND ANALYSIS OF 18S rDNA OF BALANTIDIUM CTENOPHARYNGODONI INHABITING GRASS CARP[J]. Acta Hydrobiologica Sinica, 2011, 35(2): 203-209. DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00203
Authors:LI Ming  WANG Chong  WANG Jian-Guo  YU Da-Hui  WANG Wen-Bo  GE Xian-Ping  XU Pao  XIE Jun  GONG Xiao-Ning
Affiliation:LI Ming1,2,3,WANG Chong4,WANG Jian-Guo3,YU Da-Hui1,WANG Wen-Bo1,GE Xian-Ping5,XU Pao5,XIE Jun5 and GONG Xiao-Ning3(1.Key Laboratory of Mariculture & Ecology and Quality Control,South China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Ministry of Agriculture,Guangzhou 510300,China,2.Hubei Key Laboratory of Animal Nutrition and Feed Science,Wuhan Polytechnic University,Wuhan 430023,3.State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology,Institute of Hydrobiology,Chinese Ac...
Abstract:Balantidium ctenopharyngodoni,an obligatory intestinal symbiont and possibly opportunistic parasite of grass carp(Ctenopharyngodon idella),was first discovered and named by Chen(1955).It mainly inhabits the cream-like luminal contents and spaces between mucosal folds of the hindgut.In the present study,twenty two or three-summer grass carp were bought from Wuhan Fruit-Lake Market in March 2009 and transported alive to the laboratory for further examination.All fish samples were dissected and the intestines ...
Keywords:Balantidium ctenopharyngodoni  18S rDNA  Phylogeny  
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