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氨基酸和二肽组成对嗜压微生物蛋白质稳定性的影响
引用本文:张光亚,李红春,高嘉强,方柏山. 氨基酸和二肽组成对嗜压微生物蛋白质稳定性的影响[J]. 微生物学报, 2009, 49(2): 198-203
作者姓名:张光亚  李红春  高嘉强  方柏山
作者单位:华侨大学生物工程与技术系,厦门,361021
基金项目:国家自然科学基金资助项目(No. 20806031)和福建省自然科学基金资助项目(2007J0360)
摘    要:【目的】 比较嗜压和非嗜压微生物中蛋白质在氨基酸和二肽组成上的差异对嗜压蛋白稳定性机理的了解及在此基础上的定向改造具有重要意义。【方法】利用4种微生物全蛋白质组信息,统计了639对直系同源序列二级结构氨基酸组成及二肽组成并计算其偏差。【结果】结果表明:在β折叠和无规则卷曲中二者差异明显,β折叠中,嗜压蛋白含更多的缬氨酸,异亮氨酸,亮氨酸,更少的精氨酸,赖氨酸,天冬氨酸;无规则卷曲中,嗜压蛋白含更多的缬氨酸和异亮氨酸,更少的甘氨酸和脯氨酸。而嗜压蛋白存在更多的YM、MN、KD、QC、CI、MW、MM、CY、WQ、HC、RC和QH,更少TW、MS、VD、DH、YE、CT、MW、CF、CK、CM、MY、QI、TH、MQ、QQ和MC。【结论】二肽比氨基酸包含更多的结构和序列信息,更有利于了解嗜压蛋白稳定性机制及指导其定向改造。

关 键 词:嗜压微生物  二肽组成  蛋白质稳定性  二级结构  适压机制
收稿时间:2008-09-22
修稿时间:2008-11-18

Influence of amino acid and dipeptide composition on protein stability of piezophilic microbes
Guangya Zhang,Hongchun Li,Jiaqiang Gao and Baishan Fang. Influence of amino acid and dipeptide composition on protein stability of piezophilic microbes[J]. Acta microbiologica Sinica, 2009, 49(2): 198-203
Authors:Guangya Zhang  Hongchun Li  Jiaqiang Gao  Baishan Fang
Affiliation:Department of Bioengineering and Biotechnology, Huaqiao University, Xiamen 361021, China;Department of Bioengineering and Biotechnology, Huaqiao University, Xiamen 361021, China;Department of Bioengineering and Biotechnology, Huaqiao University, Xiamen 361021, China;Department of Bioengineering and Biotechnology, Huaqiao University, Xiamen 361021, China
Abstract:
Keywords:Piezophilic microbes   dipeptide composition   protein stability   secondary structure   mechanism of piezophilic adaptation
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