基于转录组测序的细风轮花青素合成途径及关键酶基因分析 |
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引用本文: | 赵历强,单春苗,张声祥,施圆圆,马克龙,吴家文.基于转录组测序的细风轮花青素合成途径及关键酶基因分析[J].植物研究,2020,40(6):886-896. |
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作者姓名: | 赵历强 单春苗 张声祥 施圆圆 马克龙 吴家文 |
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作者单位: | 1.安徽中医药大学研究生院,合肥 2300122.安徽中医药大学科研实验中心、新安医学教育部重点实验室,合肥 2300383.安徽中医药大学中西医结合学院,合肥 2300124.安徽道地中药材品质提升协同创新中心,合肥 2300125.安徽省中医药科学院,合肥 230012 |
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基金项目: | 安徽高校自然科学研究重大项目(KJ2018ZD028);名贵中药资源可持续利用能力建设项目(2060302);国家自然科学基金(81874431);国家级大学生创新训练项目(201810369050) |
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摘 要: | 为进一步理解细风轮花青素合成途径,本研究利用华大基因BGISEQ-500平台对细风轮中的根、茎、叶、花4个组织进行了转录组测序,从头组装后得到128 856个Unigene。KEGG通路表明有40个Unigene编码了细风轮的花青素生物合成途径中6个关键酶。我们对其中的关键酶DFR(二氢黄酮醇还原酶)进行同源比对和空间结构模拟,结果显示DFR序列和结构均具有良好的保守性,且具有高度保守的NAD+结合位点,其二级结构主要由α螺旋和β折叠组成,在空间上α螺旋包裹着β折叠,形成“夹心饼干”样结构。
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关 键 词: | 细风轮 花青素 转录组 单基因 二氢黄酮醇还原酶 |
收稿时间: | 2019-11-19 |
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