| 基于全基因组系统发生的草菇基因家族显著扩增 |
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| 引用本文： | 龚明,谭琦,陈明杰,鲍大鹏,汪虹.基于全基因组系统发生的草菇基因家族显著扩增[J].微生物学报,2014,54(9):992-997. |
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| 作者姓名： | 龚明 谭琦 陈明杰 鲍大鹏 汪虹 |
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| 作者单位： | 国家食用菌工程技术研究中心，农业部南方食用菌资源利用重点实验室，上海市农业遗传育种重点开放实验室，上海市农业科学院食用菌研究所，上海201403;国家食用菌工程技术研究中心，农业部南方食用菌资源利用重点实验室，上海市农业遗传育种重点开放实验室，上海市农业科学院食用菌研究所，上海201403;国家食用菌工程技术研究中心，农业部南方食用菌资源利用重点实验室，上海市农业遗传育种重点开放实验室，上海市农业科学院食用菌研究所，上海201403;国家食用菌工程技术研究中心，农业部南方食用菌资源利用重点实验室，上海市农业遗传育种重点开放实验室，上海市农业科学院食用菌研究所，上海201403;国家食用菌工程技术研究中心，农业部南方食用菌资源利用重点实验室，上海市农业遗传育种重点开放实验室，上海市农业科学院食用菌研究所，上海201403 |
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| 基金项目： | 上海市农科发2013(10);上海市科委重点项目(10dz2212400);上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字［2011］第1-2号) |
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| 摘 要： | 【目的】从基因组层次研究草菇低温自溶异常代谢的分子特征。【方法】对21个真菌物种进行全基因组系统发生分析,进而选取其中具有代表性的物种进行比较基因组学分析,系统研究草菇异常代谢分子特征。【结果】全基因组系统发生分析结果显示草菇位于草腐菌所形成簇的底端。基于全基因组系统发生树,由于担子菌和子囊菌属于完全不同的演化路径,所以选取担子菌中具有代表性的9个物种进行比较基因组学分析,结果显示相比于其它草腐菌,草菇基因家族具有一定的收缩趋势。进一步对不同范畴的基因家族数目进行比较,结果显示3个大于200的草菇基因家族(fam1、fam4和fam6)分别发生了显著扩增,且在总数上也显著高于其它物种,表明草菇的这一分子特征与其异常代谢相关。【结论】3个草菇基因家族(200)显著扩增提示其特定基因家族功能加强,很可能与草菇低温自溶密切相关。
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| 关 键 词： | 草菇 自溶 基因扩增 全基因组 异常代谢 |
| 收稿时间： | 2013/12/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/2/25 0:00:00 |
Phylogenomic analysis reveals the significant expansion of gene families of Volvariella volvacea |
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| Ming Gong,Qi Tan,Mingjie Chen,Dapeng Bao and Hong Wang.Phylogenomic analysis reveals the significant expansion of gene families of Volvariella volvacea[J].Acta Microbiologica Sinica,2014,54(9):992-997. |
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| Authors: | Ming Gong Qi Tan Mingjie Chen Dapeng Bao and Hong Wang |
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