基于基因组数据解析金耳A和B交配型位点结构

金耳Naematelia aurantialba是我国特有的一种稀有银耳目胶体食用菌，因优异的营养价值和生物活性而常被用作传统药物和食品。它属于四极性异宗结合担子菌，但其交配型位点结构仍未被解析。本研究利用二代测序技术对4种不同交配类型的金耳单核菌株基因组进行重测序，通过生物信息学方法找到了金耳的A和B交配型位点并与其他大型真菌进行比较。结果显示4个单核体中含有2种A交配型位点和2种B交配型位点；其中2种A交配型位点都包含一对HD1和HD2基因，以典型的“头对头”方式排列，位点上下游基因的共线性较高，以脑状耳包革Naematelia encephala最高，在上下游具有保守的氧化还原酶基因和PRL22基因，而mip和β-fg基因不位于HD基因两侧，不存在紧密连锁关系。2种B交配型位点均含有1个信息素受体(STE3)和1个信息素前体基因(phB)，比较B1和B2位点发现，B1位点的STE3和phB基因紧密排列，在phB上游紧密相邻着1个B2位点没有的RVT＿1基因，在B2位点中STE3和phB基因之间插入了3个基因，其中STE12基因在B1位点没有，与其他真菌相比，B位点共线性较差，表明...