| 长野芽孢杆菌普鲁兰酶的同源建模及三维结构分析 |
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| 引用本文： | 韦旭钦,李晓明,廖东庆,黄日波.长野芽孢杆菌普鲁兰酶的同源建模及三维结构分析[J].生物信息学,2017,15(1):27-32. |
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| 作者姓名： | 韦旭钦 李晓明 廖东庆 黄日波 |
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| 作者单位： | 南宁邦尔克生物技术有限责任公司,南宁 530003,南宁邦尔克生物技术有限责任公司,南宁 530003,南宁邦尔克生物技术有限责任公司,南宁 530003,广西大学生命科学与技术学院,南宁 530004;广西科学院,南宁 530007 |
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| 摘 要： | 普鲁兰酶(Pullulanase)是脱支酶,因其能水解葡聚糖的α-1,6-糖苷键而有不同的工业应用潜力。本研究通过同源建模和分子对接的方法对长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)普鲁兰酶进行建模及其三维结构分析,表明该酶由CBM41-X45aX25-X45b-CBM48-GH13_14多结构域组成,酶蛋白中心形成其催化区,催化区的Asp619、Glu648和Asp733三个残基构成酶的催化三联体。同时,通过柔性对接研究了酶与底物分子相互作用的关系,并预测构成酶的活性中心相关氨基酸残基,为进一步改良酶的特性提供重要的理论依据。
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| 关 键 词： | 长野芽孢杆菌 普鲁兰酶 同源建模 结构分析 |
| 收稿时间： | 2016/6/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/9/8 0:00:00 |
Homology modeling and three-dimensional structure analysis of Bacillus naganoensispullulanase |
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| WEI Xuqin,LI Xiaoming,LIAO Dongqing and HUANG Ribo.Homology modeling and three-dimensional structure analysis of Bacillus naganoensispullulanase[J].China Journal of Bioinformation,2017,15(1):27-32. |
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| Authors: | WEI Xuqin LI Xiaoming LIAO Dongqing and HUANG Ribo |
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| Institution: | Guangxi Nanning Bioclone Biotechnology Co.,Ltd.,Nanning 530003,China,Guangxi Nanning Bioclone Biotechnology Co.,Ltd.,Nanning 530003,China,Guangxi Nanning Bioclone Biotechnology Co.,Ltd.,Nanning 530003,China and College of Life Science and Technology, Guangxi University ,Nanning 530004,China;Guangxi Academy of Sciences,Nanning 530007,China |
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| Abstract: | |
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