| 丙型肝炎病毒基因分型及core蛋白区的分子演化分析 |
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| 引用本文： | 万祥辉,曾照芳,杨细媚. 丙型肝炎病毒基因分型及core蛋白区的分子演化分析[J]. 生物化学与生物物理进展, 2008, 35(8): 964-968 |
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| 作者姓名： | 万祥辉 曾照芳 杨细媚 |
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| 作者单位： | 重庆医科大学检验系,临床检验诊断学省部共建教育部重点实验室,重庆市重点实验室,重庆,4000161 |
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| 摘 要： | 目前有多种方法对丙型肝炎病毒进行基因分型，但尚无一个“金标准”．为确定丙型肝炎病毒基因分型的最佳区域，从GenBank中筛选出15条对各成熟肽区域有注释，来源于不同国家地区的丙型肝炎病毒全基因组序列，分别对5′UTR区、core区、E1区、E2区及NS5B区建系统进化树．结果发现，以5′UTR区建树基因分型不完全正确，而以core区、E1区、E2区及NS5B区建树，基因分型均完全正确，但同一基因型间的核苷酸演化距离存在差异．计算5条1a型序列的core区、E1区、E2区、NS5B区的核苷酸演化距离并和全基因组序列核苷酸演化距离比较，结果发现，NS5B蛋白区基因分型最能反映病毒株间的演化关系．同时分析各序列的core区的分子演化，为发明针对core区的新的PCR-RFLP基因分型方法提供新思路．
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| 关 键 词： | 丙型肝炎病毒 基因型 分子演化 核心蛋白 |
| 收稿时间： | 2007-12-11 |
| 修稿时间： | 2008-02-11 |
Genotyping of Hepatitis C Virus and Analysis of The Molecular Evolution Based on Core Region Sequence |
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| WAN Xiang-Hui,ZENG Zhao-Fang and YANG Xi-Mei. Genotyping of Hepatitis C Virus and Analysis of The Molecular Evolution Based on Core Region Sequence[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2008, 35(8): 964-968 |
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| Authors: | WAN Xiang-Hui ZENG Zhao-Fang YANG Xi-Mei |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Laboratory Medical Diagnostics, Ministry of Education, Department of Laboratory Medicine,Chongqing Medical University, Chongqing 400016, China;Key Laboratory of Laboratory Medical Diagnostics, Ministry of Education, Department of Laboratory Medicine,Chongqing Medical University, Chongqing 400016, China;Key Laboratory of Laboratory Medical Diagnostics, Ministry of Education, Department of Laboratory Medicine,Chongqing Medical University, Chongqing 400016, China |
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