粪便留取量对粪便中细菌结构和功能的影响CSCD |
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引用本文: | 杨成聪尤利军吕瑞瑞靳昊赵志鑫孙志宏.粪便留取量对粪便中细菌结构和功能的影响CSCD[J].中国微生态学杂志,2022(6):651-656. |
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作者姓名: | 杨成聪尤利军吕瑞瑞靳昊赵志鑫孙志宏 |
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作者单位: | 1.内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室010018; |
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基金项目: | 内蒙古自治区重大专项(ZDZX2018018)。 |
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摘 要: | 目的探究不同粪便留取量对肠道菌群构成研究结果的影响,为肠道菌群构成研究中粪便样本的采集方式提供参考。方法本研究分别对全便和部分粪便进行预处理,并使用PacBio SMRT测序技术对10名志愿者的20份粪便样本进行了16S rRNA全长测序,通过多元统计学等手段对粪便中细菌的构成、多样性和功能进行比较分析。结果Eubacterium rectale、Eubacterium ventriosum和Allisonella histaminiformans等低丰度物种的相对丰度在不同粪便留取量中有一定差异,其在全便中的相对丰度均显著高于部分粪便(P<0.05)。但Wilcoxon配对检验发现粪便留取量对肠道菌群结构、多样性和功能的影响均无显著性差异(P>0.05)。不同个体间肠道菌群结构存在明显差异,且粪便留取量的影响远小于个体差异。结论全便和部分粪便两种粪便留取量对检测微生物的组成、多样性和功能无显著影响,因此取部分粪便即可满足对肠道菌群研究的要求。
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关 键 词: | 肠道菌群 PacBio SMRT 菌群构成 菌群功能 |
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