| 不同遗传背景下QsvR调控副溶血弧菌基因表达的转录组分析 |
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| 引用本文： | 王健,薛星帆,张苗苗,李雪,杨文慧,胡凌飞,周冬生,陆仁飞,张义全.不同遗传背景下QsvR调控副溶血弧菌基因表达的转录组分析[J].微生物学通报,2023,50(11):4988-5014. |
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| 作者姓名： | 王健 薛星帆 张苗苗 李雪 杨文慧 胡凌飞 周冬生 陆仁飞 张义全 |
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| 作者单位： | 南通市第三人民医院 南通大学附属南通第三医院检验科, 江苏 南通 226006;南通市第三人民医院 南通大学附属南通第三医院检验科, 江苏 南通 226006;江苏大学医学院, 江苏 镇江 212013;北京微生物流行病研究所 病原微生物与生物安全国家重点实验室, 北京 100071 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(82072239)；南通市科学技术局基础科学研究计划(JC2021027)；南通市卫生健康委员会科研课题(QN2022044) |
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| 摘 要： | 【背景】OpaR是副溶血弧菌群体感应系统的核心调控因子；QsvR是AraC家族转录调控因子，与OpaR之间具有相互调控作用；此外，QsvR对基因表达的调控作用受OpaR的影响，但是影响程度并未完全阐明。【目的】探究在野生株(wild-type,WT)和opaR基因突变株(ΔopaR)的遗传背景下QsvR的转录调控元，分析Opa R对QsvR基因表达调控的影响。【方法】分别以WT和ΔopaR为参照，采用Illumina HiSeq测序平台进行比较转录组学研究，分析生物膜形成条件下qsv R基因突变株(Δqsv R)和Δqsv RΔopaR的基因表达情况。【结果】在WT遗传背景下，QsvR共调控1735个基因的转录(调控元1)，其中被激活的基因有855个，被抑制的基因有880个；在ΔopaR遗传背景下，QsvR共调控1 187个基因的转录(调控元2)，其中被激活的基因有533个，被抑制的基因有654个。调控元1和调控元2之间共有517个重叠基因，且QsvR对绝大多数重叠基因的调控关系相反。基因属性分类(gene ontology, GO)数据库富集分析结果显示，调控元1和调控元2中分别有4...
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| 关 键 词： | 副溶血弧菌 调控元 转录组 QsvR OpaR |
| 收稿时间： | 2023/3/13 0:00:00 |
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