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基于mtDNA D-loop部分序列的软刺裸裂尻鱼遗传多样性分析
作者姓名:杨朝杰  高强  刘丹  聂苗苗  王发艳  李柯懋  赵宏  张存芳  祁得林
作者单位:青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,西宁810016;青海大学农牧学院,西宁810016;青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,西宁810016;青海省渔业技术推广中心青海省渔业环境监测中心,西宁810012;青海多美生态环保科技有限公司,西宁810003
基金项目:国家自然科学基金项目(31960098);
摘    要:软刺裸裂尻鱼Schizopygopsis malacanthus是青藏高原特有鱼类。本研究测定了青海省玉树藏族自治州3个软刺裸裂尻鱼野生群体(隆宝滩国家级自然保护区、巴塘河上游、巴塘河下游)共72尾的mtDNA D-loop的部分序列(610 bp),分析了其遗传多样性和种群遗传结构,旨在为玉树软刺裸裂尻鱼野生资源保护和合理开发提供理论依据。共发现29个多态位点,定义了16个单倍型。3个种群的单倍型多样性为0.438±0.121~0.676±0.076,核苷酸多样性为0.003 4±0.000 5~0.008 6±0.001 3。群体遗传分化指数统计检验表明,两两群体之间的差异均极显著。基因流分析结果表明,巴塘河上、下游种群之间的基因流水平较高,个体交流频繁。AMOVA分析结果显示,79.49%的遗传变异来自于种群间,20.51%的遗传变异来自于种群内,群体间遗传分化极显著。系统发育树和单倍型进化网络结果显示,3个种群的单倍型按照隆宝滩国家级自然保护区和巴塘河水系形成2大类群。中性检验结果表明,软刺裸裂尻鱼近期未出现显著的种群扩张事件。建议将分布在隆宝滩国家级自然保护区和巴塘河水系的软...

关 键 词:软刺裸裂尻鱼  D-loop  遗传多样性  种群遗传结构
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