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蛋白质折叠速度与其拓扑结构关系的研究
引用本文:赵立岭,王吉华,窦相华,苏希玉. 蛋白质折叠速度与其拓扑结构关系的研究[J]. 生物数学学报, 2005, 20(3): 332-338
作者姓名:赵立岭  王吉华  窦相华  苏希玉
作者单位:1. 德州学院,生命科学与技术研究所,山东,德州,253023;曲阜师范大学,物理学院,山东,曲阜,273100
2. 德州学院,生命科学与技术研究所,山东,德州,253023
3. 曲阜师范大学,物理学院,山东,曲阜,273100
基金项目:国家自然科学基金重点项目资助(90403120)
摘    要:以6种不同的方式来定义蛋白质内存在的接触,进而运用分子动力学模拟等不同方法,对10个小蛋白进行分析,研究了不同的接触定义及不同的拓扑参数计算方法下,蛋白质的折叠速度与其拓扑参数的关系.结果表明,用含主链重原子的方式定义接触,所计算的拓扑参数与蛋白质折叠速度的相关性较好;用含侧链原子的方式定义接触,得到的拓扑参数与β型蛋白质的折叠速度的相关性较好.对不同的蛋白质,其拓扑结构与相应折叠速度间的相关程度不同。

关 键 词:折叠速度 相对接触距 长接触距 总接触距 相关系数
文章编号:1001-9626(2005)03-0332-07
收稿时间:2003-12-20
修稿时间:2003-12-20

Study on the Relation Between Protein Folding Rate and Its Topological Structure
ZHAO Li-ling,WANG Ji-hua,DOU Xiang-hua,SU Xi-yu. Study on the Relation Between Protein Folding Rate and Its Topological Structure[J]. Journal of Biomathematics, 2005, 20(3): 332-338
Authors:ZHAO Li-ling  WANG Ji-hua  DOU Xiang-hua  SU Xi-yu
Abstract:
Keywords:Folding rate    Relative contact order    Long-rang order    Total contact distance    Correlation coefficient
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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