肠道菌群对凡纳滨对虾健康的指示作用

高密度、集约化的凡纳滨对虾养殖常伴随病害的发生，但还不能确定能否利用对虾的肠道细菌差异来指示其健康状况.因此，我们分别采集了健康和发病养殖塘水样和对虾样品，利用Illumina MiSeq测序技术测定细菌16S rRNA基因，研究细菌的群落结构和多样性.结果表明： 细菌群落结构变异主要受水体中亚硝酸盐、叶绿素a和磷酸盐的影响.发病对虾肠道细菌群落多样性显著低于健康对虾.在健康和发病对虾肠道细菌中，运用响应比分析，我们筛选到了28个丰度差异显著的分类操作单元(OTUs)，其中来源于放线菌纲、黄杆菌纲和芽孢杆菌纲的OTUs丰度在发病对虾肠道中显著降低，而隶属于梭状芽孢杆菌纲的OTUs丰度在发病对虾肠道显著增加.此外，我们挑选出61个指示物种，主要属于拟杆菌门、变形菌门、厚壁菌门、浮霉菌门和放线菌门.值得注意的是，它们能够区分样品的来源(水样或虾肠道)和健康状态.本研究为对虾病害预测和益生菌开发提供了理论依据.