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复幼促进核桃不定根发生的DNA甲基化机制探讨
引用本文:李 莉,宋晓波,常英英,张俊佩,徐慧敏,裴 东.复幼促进核桃不定根发生的DNA甲基化机制探讨[J].西北植物学报,2020,40(7):1135-1147.
作者姓名:李 莉  宋晓波  常英英  张俊佩  徐慧敏  裴 东
作者单位:(1 林木遗传育种国家重点实验室, 国家林业局林木培育重点实验室, 中国林业科学研究院 林业研究所, 北京100091; 2 中国林学会, 北京 100091; 3 河南省洛宁县林业局, 河南洛阳 471700)
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(CAFYBB2018SY006);
摘    要:该研究以核桃的复幼和成龄插穗为材料,通过甲基化修饰依赖性内切酶测序技术(MethylRAD-Seq),在全基因组水平上检测成龄与复幼插穗中DNA甲基化位点分布特征,进一步对复幼处理前后插穗中差异甲基化位点相关基因的表达情况进行分析。结果显示:(1)复幼处理可显著降低核桃插穗的DNA甲基化水平。(2)功能富集分析结果显示,差异甲基化位点相关基因主要参与油菜素内酯信号转导、次级代谢产物生物合成和木质素生物合成等功能,参与光合作用、MAPK(mitogen-activated protein kinase, MAPK)信号通路、果糖和甘露糖代谢、cAMP(cyclic AMP, CAMP)信号途径和苯丙烷生物合成等代谢通路。(3)qRT-PCR分析结果显示,复幼处理前后,不定根发生的关键调控基因NAC1、ARF5、ARF6和WRKY22在复幼和成龄材料中具有不同的表达模式。研究认为,复幼处理降低了核桃插穗中基因组DNA的甲基化水平,进而影响不定根发生过程关键功能基因的表达,可能是复幼调控核桃不定根发生能力的重要途径。

关 键 词:核桃  复幼  不定根  发育阶段转变  Methyl  RAD测序

DNA Methylation Mechanism of Adventitious Roots of Walnut Promoted by Rejuvenation
LI Li,SONG Xiaobo,CHANG Yingying,ZHANG Junpei,XU Huimin,PEI Dong.DNA Methylation Mechanism of Adventitious Roots of Walnut Promoted by Rejuvenation[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2020,40(7):1135-1147.
Authors:LI Li  SONG Xiaobo  CHANG Yingying  ZHANG Junpei  XU Huimin  PEI Dong
Abstract:
Keywords:walnut  rejuvenation  adventitious root  developmental phase change  Methyl RAD sequence
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