| 乳腺癌转移相关基因的筛选与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 余海浪 夏晓燕 丁大鹏 周珏宇 郑文岭 马文丽. 乳腺癌转移相关基因的筛选与生物信息学分析[J]. 中国生物化学与分子生物学报, 2012, 28(11): 1069-1074 |
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| 作者姓名： | 余海浪 夏晓燕 丁大鹏 周珏宇 郑文岭 马文丽 |
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| 基金项目： | 广东省医学科研基金（No. B2012203）, 广东省领军人才专项基金（No. C1030925） |
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| 摘 要： | ![]()
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤，转移与复发是乳腺癌患者死亡的主要原因. 研究与乳腺癌细胞转移相关的分子靶点对预防乳腺癌术后复发、提高疗效有重要意义. 本研究以3组乳腺癌转移相关的基因表达谱数据(GSE2034, GSE2603, GSE12276)为分析材料，采用GeneSpring软件筛选乳腺癌原发瘤与转移瘤芯片数据的差异表达基因，结合生物信息学工具PATHER、STRING、pSTIING和文献挖掘工具iHOP对差异基因及其相互作用关系进行分析. 结果显示，共筛选出乳腺癌转移共同差异基因147个，其中表达上调93个，表达下调54个. 这些差异基因主要涉及细胞周期与增殖、细胞粘附、细胞迁移、血管形成及信号转导等生物通路和生物过程. 差异基因编码蛋白间的相互作用主要集中在14个蛋白，且在更为复杂的网络图谱中仍可见其中9个基因（CXCR4、MMP1、MMP2、MMP3、CTGF、COL1A1、MEF2C、PTGS2及SPARC）在重要的节点位置. 文献挖掘发现,COL1A1基因可能为新发现的乳腺癌转移候选基因，为乳腺癌转移的发病机制提供新的思路，也为转移性乳腺癌的分子诊断和个体化治疗奠定基础.
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| 关 键 词： | 乳腺癌 转移 基因 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2012-06-25 |
Identification and Bioinformatic Analysis of Breast Cancer Metastasis Related Genes in Breast Cancer |
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| YU Hai-Lang,XIA Xiao-Yan,DING Da-Peng,ZHOU Jue-Yu,ZHENG Wen-Ling,MA Wen-Li. Identification and Bioinformatic Analysis of Breast Cancer Metastasis Related Genes in Breast Cancer[J]. Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology, 2012, 28(11): 1069-1074 |
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| Authors: | YU Hai-Lang XIA Xiao-Yan DING Da-Peng ZHOU Jue-Yu ZHENG Wen-Ling MA Wen-Li |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | |
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