| 番茄P56和部分来源多糖裂解酶家族Ⅰ的其它蛋白的系统演化分析 |
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| 引用本文： | 赵庆新,张宇玲.番茄P56和部分来源多糖裂解酶家族Ⅰ的其它蛋白的系统演化分析[J].武汉植物学研究,2007,25(3):282-288. |
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| 作者姓名： | 赵庆新 张宇玲 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省滩涂生物资源与环境保护重点建设实验室,盐城师范学院生命科学与技术学院,江苏盐城,224002;江苏省生物多样性和生物技术重点实验室,南京师范大学生命科学学院微生物技术实验室,南京,210097
2. 江苏省生物多样性和生物技术重点实验室,南京师范大学生命科学学院微生物技术实验室,南京,210097 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;江苏省教育厅高校自然科学指导性项目;盐城师范学院博士科研启动基金 |
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| 摘 要： | 果胶裂解酶包含果胶酸裂解酶(pectate lyase)和果胶酸酯裂解酶(pectin lyase)二种形式,是一类多糖裂解酶,由细菌、真菌、植物和线虫等生物产生,分布在5个多糖裂解酶家族,果胶酶在食品与饮料、纺织与洗涤、制药等工业中有广泛的应用。利用NCBI BLASTX服务器,搜索与番茄P56蛋白氨基酸序列相似且都属于多糖裂解酶家族Ⅰ的果胶裂解酶蛋白序列共28条,用DNAMAN软件分析其保守区,用CLUSTALX8.0软件进行序列比对和Bi-oEdit软件进行文件转换,进一步用PUAP4.0软件构建系统进化树。构建的MP树(phylogenetic trees)和NJ树(neighbor-joining)显示:来自植物的果胶酸裂解酶、真菌的果胶酸酯裂解酶、细菌的果胶酸裂解酶分别可聚为一个独立的类群;相对于细菌果胶酸裂解酶和真菌果胶酸酯裂解酶而言,构巢曲霉(Aspergillus nidulans)的果胶酸裂解酶A和植物的果胶酸裂解酶之间有较近的亲缘关系;细菌Pseudomonas syringae的果胶酸酯裂解酶和真菌的果胶酸酯裂解酶之间的亲缘关系较近。
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| 关 键 词： | 果胶酸裂解酶 果胶酸酯裂解酶 多糖裂解酶家族Ⅰ 系统演化树 |
| 文章编号： | 1000-470X（2007）03-0282-07 |
| 修稿时间： | 2006-12-042007-03-29 |
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