| 昆虫质型多角体病毒同义密码子使用模式分析 |
| |
| 引用本文： | 石生林,姜义仁,杨瑞生,刘彦群,赵金莹,秦利. 昆虫质型多角体病毒同义密码子使用模式分析[J]. 昆虫知识, 2013, 50(4): 1020-1029 |
| |
| 作者姓名： | 石生林 姜义仁 杨瑞生 刘彦群 赵金莹 秦利 |
| |
| 作者单位： | 1. 沈阳农业大学植物保护博士后流动站 沈阳110866;沈阳农业大学生物科学技术学院 沈阳110866;辽宁省昆虫资源工程技术研究中心 沈阳 110866
2. 沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110866;辽宁省昆虫资源工程技术研究中心 沈阳 110866 |
| |
| 基金项目： | 现代农业产业技术体系专项 |
| |
| 摘 要： | 昆虫质型多角体病毒(cypovirus,CPV)是害虫种群重要调节因子,可用作生物防治剂。本研究采用多元统计分析方法对7种CPV进行密码子使用模式分析,结果表明:CPV密码子使用偏好性较弱,多数基因密码子使用模式受碱基组成影响,少数基因密码子使用模式除碱基组成外还有其它影响因素;中性绘图分析表明碱基组成主要受选择压力影响,受突变影响较小。同一电泳型CPV之间比同一宿主CPV之间共有的偏好性密码子多。CPV基因组内10个基因组片段之间密码子偏好性存在差异。CPV密码子偏好性与宿主昆虫密码子偏好性存在差异,所有CPV与其宿主昆虫共有的偏好性密码子均较少。对应分析进一步证明碱基组成是影响密码子使用的主要因素,不同电泳型CPV具有不同的密码子使用模式。聚类分析表明同一电泳型CPV密码子使用模式相似,同一宿主CPV密码子使用模式差异较大。
|
| 关 键 词： | 有效密码子数 ENc-plot分析 中性绘图分析 对应分析 偏好性密码子 |
Analysis of synonymous codon usage patterns in insect cypoviruses |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | effective number of codons ENc-plot analysis neutrality plot analysis correspondence analysis preferred codons |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
