| 家蚕浓核病毒 Bm DNV-3(中国株)VD1基因组结构与转录分析 |
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| 引用本文： | 王永杰,姚勤,陈克平,韩序. 家蚕浓核病毒 Bm DNV-3(中国株)VD1基因组结构与转录分析[J]. 生物工程学报, 2006, 22(5): 707-712. DOI: 10.1016/S1872-2075(06)60052-6 |
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| 作者姓名： | 王永杰 姚勤 陈克平 韩序 |
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| 作者单位： | 1. 江苏大学生命科学研究院,镇江,212013;安徽省农业科学院水产研究所,合肥,230031
2. 江苏大学生命科学研究院,镇江,212013 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金;国家重点基础研究发展计划(973计划) |
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| 摘 要： | 为了进一步认识家蚕浓核病毒BmDNV-3(中国株)VD1基因组的结构和功能,VD1被分离、纯化、克隆到pUC119载体上,完成了基因组全序列的测定。序列分析显示VD1基因组全长为6543个核苷酸,末端拥有224个核苷酸反向重复序列(ITRs)。VD1基因组正链含有3个大的开放阅读框(ORF1-3),负链含有1个大的开放阅读框(ORF4)。比较BmDNV-3的VD1和BmDNV-2(Yamanashiisolate)的VD1基因组全序列,两者同源性为98.4%,并且有107个碱基的替代和1个碱基插入,氨基酸突变集中在VD1ORF3和VD1ORF4。Northern杂交结果显示VD1的左边正链上有1.1kb和1.5kb两个转录本,右边的负链上有一个3.3kb转录本。3′和5′-RACE结果显示1.1kb转录本开始于nt290,结束于nt1437;1.5kb转录本开始于nt1423,结束于nt2931;3.3kb转录本开始于nt6287,结束于nt2922。正链上1.5kb转录本和负链上3.3kb转录本拥有10个核苷酸的3′端的共同序列。研究结果显示该病毒基因转录与已报道的其它浓核病毒存在较大的差异性。
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| 关 键 词： | 家蚕浓核病毒 序列分析 转录分析 |
| 文章编号： | 1000-3061(2006)05-0707-06 |
| 收稿时间： | 2006-06-07 |
| 修稿时间： | 2006-06-20 |
Organization and Transcription Strategy of Genome of Bombyx mori Bidensovirus (China isolate) VD1 |
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| WANG Yong-Jie,YAO Qin,CHEN Ke-Ping,HAN Xu. Organization and Transcription Strategy of Genome of Bombyx mori Bidensovirus (China isolate) VD1[J]. Chinese journal of biotechnology, 2006, 22(5): 707-712. DOI: 10.1016/S1872-2075(06)60052-6 |
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| Authors: | WANG Yong-Jie YAO Qin CHEN Ke-Ping HAN Xu |
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| Affiliation: | 1. Institute of Life Sciences, Jiangsu University, Zhenfiang 212013, China; 2. Institute of Fisheries, Anhui Academy of Agricultural Sciences, Hefei 230031, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bombyx mori bidensovirus VD-1 Sequence analysis Nothern blotting analysis |
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