基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因 |
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引用本文: | 吕亚娜,陈丽娜,徐晋,李琬,苗正强,曲晓莉,张思雅,李为国,贾婿. 基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因[J]. 现代生物医学进展, 2013, 13(4): 613-619 |
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作者姓名: | 吕亚娜 陈丽娜 徐晋 李琬 苗正强 曲晓莉 张思雅 李为国 贾婿 |
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作者单位: | 1. 哈尔滨医科大学基础医学院 黑龙江哈尔滨150081 2. 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 黑龙江哈尔滨150081 |
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基金项目: | 黑龙江省教育厅基金,国家自然科学基金项目,黑龙江省自然科学基金,黑龙江省研究生创新科研资金,黑龙江大学创新基金 |
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摘 要: | 目的:基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因.方法:从系统生物学的角度,提出基于蛋白质亚细胞定位信息,构建区域化的蛋白质互作的整合网络;通过疾病风险基因与已知致病基因的功能一致性程度和互作相关性的强度联合筛选的新策略,预测心肌梗死的新致病基因.结果:预测出10个心肌梗死的新致病基因(CCL19、CCL25、COMP、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、HTR6、ADRB1、BDKRB2),其中8个基因(CCL 19、CCL25、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、ADRB1、BDKRB2)经文献证实与心肌梗死的发生发展有着密切的联系;另外2个基因(COMP、HTR6)尚需实验验证.结论:基于整合网络和联合策略预测出10个心肌梗死的新致病基因,此方法为探索复疾病的致病基因提供了新的思路,有助于阐明复杂疾病的致病机理.
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关 键 词: | 心肌梗死 蛋白质互作网络 亚细胞定位信息 功能一致性 |
Prediction of the New Pathogenic Genes of Myocardial Infarction Based on Integrated Network and Joint Strategy |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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