应用高分辨率熔解曲线分析石蜡标本中KRAS基因突变 |
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引用本文: | 张海燕,王捷,吴小丽,冼江. 应用高分辨率熔解曲线分析石蜡标本中KRAS基因突变[J]. 现代生物医学进展, 2013, 13(13): 2406-2410 |
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作者姓名: | 张海燕 王捷 吴小丽 冼江 |
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作者单位: | 1. 广州军区广州总医院医学实验科 广东广州510010 2. 中国科学院传感技术联合国家重点实验室 上海200050 |
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基金项目: | China,广东省自然科学基金项目 |
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摘 要: | 目的:KRAS基因在结直肠癌患者突变率为30%~50%,并且KRAS基因状态与抗EGFR抗体疗效的密切相关.常用的直接测序法其检测灵敏度低、容易出现假阴性结果.采用高分辨率溶解曲线分析法检测结直肠癌中KRAS基因突变,探索其应用于临床检测的可行性.方法:本文收集20例结直肠癌患者石蜡包埋组织标本,应用高分辨率熔解曲线方法检测KRAS基因突变(2,3号外显子).将KRAS基因突变型DNA(p.G12D)和野生型DNA梯度混合稀释,突变型DNA浓度分别为40%、20%、10%、2%,进行高分辨率熔解曲线方法进行检测,并将扩增产物进行直接测序,比较两种方法的灵敏度.结果:在20例结直肠癌患者中检出5例2号外显子突变,p.G12D 2例,p.G12V 2例,p.G13D 1例,3号外显子未检出突变.HRM方法检测基因突变的检出限可达2%,直接测序法检测基因突变的检出限为20%.结论:HRM法比直接测序法灵敏度高,能精确检测出结直肠癌石蜡标本中低浓度的KRAS突变,有望应用于临床基因突变检测.
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关 键 词: | 高分辨率熔解曲线 结直肠癌 KRAS 基因突变 |
KRAS Mutational Status Analysis in Formalin-fixed, Paraffin-Embedded Tissues using High-resolution Melting Analysis |
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Abstract: | |
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Keywords: | High resolution melting Colorectal cancer KRAS Gene mutation |
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