| 马铃薯StSnRK2.1基因克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘思妍,毛娟,范阿棋,张俊莲,王蒂,白江平.马铃薯StSnRK2.1基因克隆与生物信息学分析[J].生物技术通报,2013(3):83-89. |
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| 作者姓名： | 刘思妍 毛娟 范阿棋 张俊莲 王蒂 白江平 |
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| 作者单位： | 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃省干旱生境作物学重点实验室甘肃农业大学农学院 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划(2012BAD06B03);国家马铃薯产业技术体系;甘肃省科技重大专项计划(1102NKDA025);甘肃省财政厅农牧林业务专项资金;甘肃农业大学SRTP科研项目(20120104) |
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| 摘 要： | SnRK2基因对植物的逆境胁迫具有重要的调节作用,以马铃薯‘陇薯3号’(Solanum tuberosum)为试材,采用RT-PCR方法从马铃薯试管苗中克隆得到1个SnRK2.1基因cDNA,命名为StSnRK2.1,提交GenBank注册,注册号为JX280911。通过生物信息学分析,该基因开放阅读框全长1 008 bp,编码335个氨基酸。预测蛋白质分子量约为37.77 kD,等电点为5.37,蛋白质二级结构预测α-螺旋42.39%,延伸链16.42%,β-折叠7.46%,无规卷曲33.73%,具有疏水性,为膜内蛋白。亚细胞定位显示该基因出现在细胞质及微体中的可能性较大。肽链可能有7处丝氨酸磷酸化位点,2处苏氨酸磷酸化位点,以及3处酪氨酸磷酸化位点,因此推测该基因在植物抗逆中有重要的作用。
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| 关 键 词： | 马铃薯 抗旱 基因克隆 生物信息学分析 |
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