| 低温胁迫下两种不同形态群体拟穴青蟹转录组分析 |
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| 引用本文： | 陈洁,董梦,崔悦,房翠莲,陈旭堂,刘子明.低温胁迫下两种不同形态群体拟穴青蟹转录组分析[J].水生生物学报,2022,46(8):1256-1264. |
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| 作者姓名： | 陈洁 董梦 崔悦 房翠莲 陈旭堂 刘子明 |
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| 作者单位： | 1. 丽水学院生态学院 |
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| 基金项目： | 国家自然基金(32002407)资助~~； |
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| 摘 要： | 为研究拟穴青蟹(Scylla paramamosain)不同形态群体对温度变化的适应差异,以Sp1群体(腕节外缘中部都不具有发达的刺)和Sp2群体(至少一只螯足腕节外缘中部具有发达的刺)为研究对象,选用低温胁迫组(8℃)和对照组(20℃)拟穴青蟹肝胰腺为实验材料,进行转录组测序。结果显示,测序共获得81853个Unigene,平均长度为420 bp, N50为1460 bp,其中22.33%为已知基因。差异表达基因筛选发现Sp1群体在低温胁迫下共有15773个Unigene显著差异表达,其中15628个Unigene表达下调, 145个Unigene表达上调,这些Unigene显著富集于细胞质基质等生物学过程和RNA结合、核糖体结构组分等分子功能,并进一步富集在核糖体、剪接体和内质网蛋白质加工等信号通路。Sp2群体在低温胁迫下共有323个Unigene显著差异表达,其中上调114个,下调209个。这些Unigene显著富集于DNA整合等生物学过程和甾体羟化酶活性、碳酸氢盐跨膜转运体活性等分子功能,并进一步富集在赖氨酸降解、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢、精氨酸和脯氨...
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| 关 键 词： | 低温胁迫 形态群体 转录组分析 拟穴青蟹 |
| 收稿时间： | 2021-07-06 |
TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF TWO DIFFERENT MORPHOLOGICAL POPULATIONS OF SCYLLA PARAMAMOSAIN UNDER COLD STRESS |
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