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鼻咽癌相关基因TP53、COL1A1、FN1的表达及意义
引用本文:谢慧芬,张庆丰,张楠楠,钟颖,谢民强.鼻咽癌相关基因TP53、COL1A1、FN1的表达及意义[J].基因组学与应用生物学,2022(Z1):2029-2038.
作者姓名:谢慧芬  张庆丰  张楠楠  钟颖  谢民强
作者单位:1. 深圳大学总医院;2. 南方医科大学珠江医院;3. 珠海市人民医院
基金项目:国家自然科学基金项目(81372477; 81673013);;广东省科技计划项目(2017A010103010)共同资助;
摘    要:鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)是我国发病率较高的头颈部恶性肿瘤,但其发病机制仍不清楚。本文采用生物信息学方法筛选NPC差异基因,通过免疫组化进一步分析其在NPC组织和慢性鼻咽炎(chronic nasopharyngitis, CN)组织中的表达及意义。首先,使用R语言从基因表达综合数据库(gene expression omnibus, GEO)和人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)中筛选出NPC差异基因,对这些基因进行基因本体论(gene ontology, GO)分析、京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析及蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析,利用免疫组化实验检测相关基因在NPC组织和CN组织中的表达情况。结果显示,从GEO数据库中共筛选出257个NPC差异表达基因,其中上调基因50个,下调基因207个;从OMIM数据库检索到了2...

关 键 词:鼻咽癌  差异表达基因  生物信息学  免疫组化
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