鼻咽癌相关基因TP53、COL1A1、FN1的表达及意义 |
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引用本文: | 谢慧芬,张庆丰,张楠楠,钟颖,谢民强.鼻咽癌相关基因TP53、COL1A1、FN1的表达及意义[J].基因组学与应用生物学,2022(Z1):2029-2038. |
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作者姓名: | 谢慧芬 张庆丰 张楠楠 钟颖 谢民强 |
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作者单位: | 1. 深圳大学总医院;2. 南方医科大学珠江医院;3. 珠海市人民医院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81372477; 81673013);;广东省科技计划项目(2017A010103010)共同资助; |
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摘 要: | 鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)是我国发病率较高的头颈部恶性肿瘤,但其发病机制仍不清楚。本文采用生物信息学方法筛选NPC差异基因,通过免疫组化进一步分析其在NPC组织和慢性鼻咽炎(chronic nasopharyngitis, CN)组织中的表达及意义。首先,使用R语言从基因表达综合数据库(gene expression omnibus, GEO)和人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)中筛选出NPC差异基因,对这些基因进行基因本体论(gene ontology, GO)分析、京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析及蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析,利用免疫组化实验检测相关基因在NPC组织和CN组织中的表达情况。结果显示,从GEO数据库中共筛选出257个NPC差异表达基因,其中上调基因50个,下调基因207个;从OMIM数据库检索到了2...
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关 键 词: | 鼻咽癌 差异表达基因 生物信息学 免疫组化 |
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