苔藓NAC基因家族的生物信息学分析 |
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引用本文: | 周士钊,罗婷,刘莉.苔藓NAC基因家族的生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2022(4):822-833. |
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作者姓名: | 周士钊 罗婷 刘莉 |
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作者单位: | 1. 中国科学院昆明植物研究所资源植物与生物技术所级重点实验室;2. 中国科学院大学;3. 湖北大学生命科学学院生物催化与酶工程国家重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31971410)资助; |
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摘 要: | NAC (NAM, ATAF, CUC)转录因子家族仅存在于陆生植物中,在植物发育、响应胁迫以及生物合成过程中发挥重要作用。许多NAC家族成员的功能已被确定(主要在模式植物中),但在苔藓等早期陆生植物中NAC家族的进化过程尚不清楚。本研究从藓类的小立碗藓(Physcomitrella patens)和泥炭藓(Sphagnum fallax)、苔类的地钱(Marchantia polymorpha)和角苔类的角苔(Anthoceros angustus)中,共鉴定出97个NAC基因,并对其进行NAC转录因子家族进化分析。藓类有大约40个NAC基因,地钱和角苔中只有大约10个NAC基因。在苔藓植物中,NAC基因家族可分为5个亚家族。基因结构和保守结构域分析表明,在同一个亚家族中,大多数NAC基因具有相似的基因结构和编码相似的蛋白基序。共线性分析表明NAC-Ⅱ基因位于藓类植物保守共线性区,并随着藓类植物的整个基因重复事件而扩张。上述研究结果表明NAC基因的扩张不仅发生在维管植物中,也发生在苔藓植物中,这对NAC基因家族的功能扩展是至关重要的。进一步研究结果显示,NAC基因家族的扩增时间与藓类...
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关 键 词: | NAC基因家族 全基因组分析 全基因组重复 苔藓植物基因组共线性比较 |
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