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大通牦牛ApoA1基因克隆及生物信息学分析与组织表达谱分析
作者姓名:王福彬  吴晓云  顾亚荣  郑青波  马晓明  褚敏  阎萍  潘和平
作者单位:1. 西北民族大学生命科学与工程学院;2. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
基金项目:现代农业(肉牛牦牛)产业技术体系建设专项资金(CARS-37);;中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-2014-LIHPS-01)共同资助;
摘    要:本试验旨在分析大通牦牛(Bos grunniens)ApoA1基因的分子特征,并检测其在不同组织的表达规律,为进一步研究ApoA1基因的功能提供理论依据。试验以牦牛肝脏cDNA为模板,通过PCR扩增和基因克隆获得牦牛ApoA1基因编码区序列(coding region sequence, CDS),并进行生物信息学分析;利用RT-qPCR技术检测ApoA1基因mRNA在心脏、肌肉、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、子宫角、脂肪和输卵管等组织中的mRNA表达水平。结果表明,大通牦牛ApoA1基因编码区序列长798 bp,编码265个氨基酸;ApoA1蛋白质的分子质量为30 324.414 Da,理论等电点为5.71;蛋白质二级结构以α-螺旋(93.58%)为主;牦牛ApoA1蛋白为不稳定亲水蛋白,存在信号肽,为分泌蛋白,不存在跨膜结构域;牦牛ApoA1基因的核苷酸序列与黄牛相应序列相似度最高,同源性为99.64%;组织表达谱分析表明,ApoA1基因在大通牦牛不同组织中都表达,但在肝脏中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05)。这些结果为进一步研究大通牦牛ApoA1基因在大通牦牛结构和功能...

关 键 词:牦牛  ApoA1基因  克隆  生物信息学分析  组织表达谱分析
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