红鳍东方鲀ctgf基因的SNPs筛选及其与早期生长性状的关联分析 |
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引用本文: | 周金旭,王宁,徐浩,王冠,马文超,杨晓,肖龙,刘圣聪,仇雪梅,孟雪松,王秀利.红鳍东方鲀ctgf基因的SNPs筛选及其与早期生长性状的关联分析[J].基因组学与应用生物学,2022(4):762-770. |
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作者姓名: | 周金旭 王宁 徐浩 王冠 马文超 杨晓 肖龙 刘圣聪 仇雪梅 孟雪松 王秀利 |
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作者单位: | 1. 大连海洋大学水产与生命学院;2. 大连天正实业有限公司 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2019YFD0900503);;财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系项目(CARS-47); |
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摘 要: | 结缔组织生长因子(connective tissue growth factor, CTGF)是一种分泌蛋白,可调节细胞的增殖、分化和生长。为探究ctgf基因是否存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)及其与红鳍东方鲀早期生长性状的相关性,本研究对2月龄的893个红鳍东方鲀个体的体重、体长和体全长早期的生长性状进行了测定,筛选了ctgf基因上的SNPs位点,利用最小二乘法分析了SNPs与早期生长性状间的相关性。结果表明,在ctgf基因上存在14个SNP位点,其中C23T、G39T和C270G位点为错义突变,这些位点编码的氨基酸种类由苏氨酸、亮氨酸和丙氨酸分别变为甲硫氨酸、苯丙氨酸和甘氨酸。C23T、G39T和C270G位点均与红鳍东方鲀早期生长性状相关,其中C23T位点的CC基因型个体的体长极显著长于CT基因型个体的体长(P<0.01);G39T位点TT基因型在体全长上显著大于GG基因型和GT基因型个体的体全长(P<0.05),TT基因型个体在体重和体长这两个生长性状上极显著大于GG基因型和GT基因型个体的体重和体全长(P...
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关 键 词: | 红鳍东方鲀 结缔组织生长因子(ctgf)基因 单核苷酸多态性 早期生长性状 |
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