| 割手密SnRK2基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫表达分析 |
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| 引用本文： | 吕绍芝,钱禛锋,饶席兵,吴华英,何丽莲,李富生.割手密SnRK2基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫表达分析[J].西北植物学报,2024,44(5):729-738. |
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| 作者姓名： | 吕绍芝 钱禛锋 饶席兵 吴华英 何丽莲 李富生 |
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| 作者单位： | 云南农业大学 农学与生物技术学院,云南农业大学 农学与生物技术学院,云南农业大学 农学与生物技术学院,云南农业大学 农学与生物技术学院,云南农业大学 农学与生物技术学院,云南农业大学 农学与生物技术学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31960451）；国家重点研发计划项目（2018YFD1000503）；云南省作物生产与智慧农业重点实验室专项（202105AG070007）；云南省重大科技专项（202202AE090021） |
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| 摘 要： | 【目的】探究割手密SnRK2基因家族成员在干旱胁迫中的调控机制，为抗旱性甘蔗品种的选育提供侯选基因。【方法】以全基因组数据为基础从割手密中鉴定SnRK2基因，并对其进行生物信息学分析和干旱胁迫下的表达分析。【结果】在割手密基因组中共鉴定出11个SnRK2基因家族成员，命名为SsSnRK2.1-SsSnRK2.11,且这些基因不均匀地分布于8条染色体上。SnRK2蛋白的氨基酸残基数为227～580,分子质量为25 683.53～64 695.8 kD,等电点为4.62～8.94,且均为亲水性蛋白。系统发育树可将其分为3个亚组，且同亚组中的保守基序基本相似，外显子数量以7～9个为主。SsSnRK2基因家族成员的启动子中含有多种激素类和逆境胁迫响应类的作用元件。割手密SsSnRK2基因家族成员的表达具有组织特异性。所有的SsSnRK2基因均能不同程度地响应干旱胁迫。【结论】割手密SnRK2基因家族在响应干旱胁迫过程中发挥重要作用，可为割手密的抗逆性研究提供一定的理论依据。
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| 关 键 词： | 割手密 SnRK2基因家族 干旱胁迫 表达分析 |
| 收稿时间： | 2023/10/22 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/12/8 0:00:00 |
Genome-wide Identification and Drought Stress Expression Analysis of SnRK2 Gene Family in Saccharum spontaneum L. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Saccharum spontaneum L SnRK2 gene family drought stress expression analysis |
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