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薰衣草DXS基因家族的全基因组鉴定和表达分析
引用本文:克拉热木·克里木江,陈永坤,李翠翠,贺启琛,陈凌娜.薰衣草DXS基因家族的全基因组鉴定和表达分析[J].基因组学与应用生物学,2023(9):919-926.
作者姓名:克拉热木·克里木江  陈永坤  李翠翠  贺启琛  陈凌娜
作者单位:新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室干旱区植物逆境生物学实验室新疆师范大学生命科学学院
基金项目:新疆师范大学博士科研启动基金(XJNUBS2109)共同资助;
摘    要:脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase, DXS)是植物萜类生物合成甲基苏糖醇磷酸(methylerythritol phosphate, MEP)途径的第一个关键酶,在薰衣草(Lavandula angustifolia)萜类物质的生物合成中起重要作用。本研究中,通过薰衣草全基因组序列分析发现了DXS家族(命名为LaDXS)的22个成员,处于4个进化分支中。多数LaDXS是以α-螺旋和无规则卷曲为主的稳定性蛋白,其氨基酸数量在143~848,分子量为15.6~91.4 kDa,没有明显的信号肽和跨膜结构域,其中72%的成员定位于叶绿体。基因表达分析结果显示LaDXS在薰衣草不同组织中具有差异表达,La23G00913和La07G01277在除花瓣以外的各组织中的表达量显著;La11G00786、La17G01254和La22G01334在花蕾及花萼中的表达量最高,这可能与薰衣草精油中萜类合成密切相关。启动子分析结果显示它们受光强度、茉莉酸甲酯以及脱落酸等多种因素调节。RT-qPCR分析确认La11G00786、...

关 键 词:薰衣草  LaDXS基因家族  萜类生物合成  表达分析  光诱导
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