基于全基因组的温州光唇鱼源大肠杆菌E105的致病性与耐药性解析 |
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作者姓名: | 邹文腾 杨靖璇 陆阳阳 刘振红 高梦 杨志军 李言 王黎明 彭开松 |
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作者单位: | 1. 安徽农业大学动物科技学院,水生健康与渔药创制室 |
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基金项目: | 安徽省现代农业产业技术体系项目(皖农科函[2021] 711号)资助; |
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摘 要: | 为了加深对鱼源大肠杆菌(Escherichia coli)的理解,以全基因组测序为基础,解析了温州光唇鱼(Acrossocheilus wenchowensis)源大肠杆菌E105致病性和耐药性的表型与基因型间的关系,以期丰富大肠杆菌的病原学知识。结果显示,E105全基因组包括染色体基因组(5 022 520 bp)和6个质粒基因组,共预测到4 823个编码基因,4 510个基因被COG聚类到22类,1 140个基因富集到KEGG的22条代谢通路。E105与人(Homo sapiens)源(GenBank ID CP068822.1)和鸭(Anatinae)源(GenBank ID JAGFYD010000001)大肠杆菌基因组共线性程度更高。E105血清型为O108:H9,E105为EAEC/EHEC/EPEC混合致病型。E105中有170个毒力基因。E105对小鼠(Mus musculus)和大口黑鲈(Micropterus salmoides)的半数致死浓度(median lethal dose,LD50)分别为6.67×105 CFU/g和2.61×10<...
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关 键 词: | 温州光唇鱼 大肠杆菌 全基因组 致病性 耐药性 |
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