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基于全基因组的温州光唇鱼源大肠杆菌E105的致病性与耐药性解析
作者姓名:邹文腾  杨靖璇  陆阳阳  刘振红  高梦  杨志军  李言  王黎明  彭开松
作者单位:1. 安徽农业大学动物科技学院,水生健康与渔药创制室
基金项目:安徽省现代农业产业技术体系项目(皖农科函[2021] 711号)资助;
摘    要:为了加深对鱼源大肠杆菌(Escherichia coli)的理解,以全基因组测序为基础,解析了温州光唇鱼(Acrossocheilus wenchowensis)源大肠杆菌E105致病性和耐药性的表型与基因型间的关系,以期丰富大肠杆菌的病原学知识。结果显示,E105全基因组包括染色体基因组(5 022 520 bp)和6个质粒基因组,共预测到4 823个编码基因,4 510个基因被COG聚类到22类,1 140个基因富集到KEGG的22条代谢通路。E105与人(Homo sapiens)源(GenBank ID CP068822.1)和鸭(Anatinae)源(GenBank ID JAGFYD010000001)大肠杆菌基因组共线性程度更高。E105血清型为O108:H9,E105为EAEC/EHEC/EPEC混合致病型。E105中有170个毒力基因。E105对小鼠(Mus musculus)和大口黑鲈(Micropterus salmoides)的半数致死浓度(median lethal dose,LD50)分别为6.67×105 CFU/g和2.61×10<...

关 键 词:温州光唇鱼  大肠杆菌  全基因组  致病性  耐药性
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