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一种基于13个基因的结直肠癌预后风险预测模型的开发和验证
作者姓名:荀德旭  冯舒琪  赵园春  闫东辉  张元辰  陈佳佳  吴杰  齐鑫
作者单位:1. 苏州科技大学化学与生命科学学院;2. 苏州大学附属第一医院肿瘤科
基金项目:国家自然科学基金面上项目(32270705)资助;
摘    要:结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是全球范围内最常见的消化道恶性肿瘤之一,鉴于基因的异常表达在CRC发病机制中的关键作用,本研究旨在开发一种多基因预后风险预测模型以对CRC患者的生存结果进行分层和预测。在3个独立的转录组数据集中鉴定人类CRC肿瘤组织样本和正常结直肠组织样本之间的显著差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);基于219个重叠的DEGs,通过单因素Cox回归分析鉴定出31个具有预后价值的基因;采用LASSO Cox回归分析构建一个由13个基因组成的预后模型,其预后预测效果通过KM(Kaplan-Meier)生存分析和时间依赖性ROC分析在验证集中得到验证。多因素Cox回归分析表明,基于该模型的风险评分可以作为CRC患者生存结局[包括总生存期(overall survival,OS)、无病生存期(disease free survival,DFS)和疾病特异性生存期(disease special survival,DSS)]的独立预测因子。功能分析表明,该模型与CRC患者的免疫状态和化疗反应密切相关。此外,...

关 键 词:结直肠癌  预后模型  生存预测  免疫状态  化疗反应
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