| 玉米SAUR基因家族的鉴定与生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 郭栋,杜媚,周宝元,刘颖慧,赵明.玉米SAUR基因家族的鉴定与生物信息学分析[J].植物遗传资源学报,2019(1):90-99. |
| |
| 作者姓名： | 郭栋 杜媚 周宝元 刘颖慧 赵明 |
| |
| 作者单位： | 中国农业科学院作物科学研究所;河北北方学院 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划(2016YFD0300207;2016YFD0300103)~~ |
| |
| 摘 要： | 为研究玉米早期应答生长素基因SAUR(Small auxin-up RNA)家族,本研究采用全基因组信息鉴定出91个玉米SAUR基因,命名为ZmSAUR。SAUR家族成员基因结构、氨基酸特点、染色体定位及基因进化分析表明,SAUR基因家族在染色体上呈现不均匀分布,其中2号染色体上数量最多为22个,基因的扩增模式为分散复制与片段复制。SAUR基因家族具有相对保守的结构,即包含1个保守的Rna DNA结构,SAUR蛋白的3D结构含有3个α螺旋和3个β折叠。根据多物种SAUR蛋白进化树分析将其分为9个分支,并分析发现玉米与物种相近的谷子聚在一起。这些信息为玉米SAUR基因家族功能分析奠定了一定的工作基础。
|
| 关 键 词： | 玉米 生长素 SAUR |
Identification and Bioinformatics Analysis of Maize SAUR Gene Family |
| |
| GUO Dong,DU Mei,ZHOU Bao-yuan,LIU Ying-hui,ZHAO Ming.Identification and Bioinformatics Analysis of Maize SAUR Gene Family[J].Journal of Plant Genetic Resources,2019(1):90-99. |
| |
| Authors: | GUO Dong DU Mei ZHOU Bao-yuan LIU Ying-hui ZHAO Ming |
| |
| Institution: | (Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081;Hebei North University,Zhangjiakou 075000) |
| |
| Abstract: | GUO Dong;DU Mei;ZHOU Bao-yuan;LIU Ying-hui;ZHAO Ming(Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081;Hebei North University,Zhangjiakou 075000) |
| |
| Keywords: | maize auxin SA UR |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
|
