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杜仲叶片不同发育时期数字基因表达谱分析
引用本文:荆 腾,王 淋,乌云塔娜,杜红岩. 杜仲叶片不同发育时期数字基因表达谱分析[J]. 西北植物学报, 2016, 36(2): 257-265
作者姓名:荆 腾  王 淋  乌云塔娜  杜红岩
作者单位:(1 中国林业科学研究院经济林研究开发中心,郑州 450003;2 国家林业局杜仲工程技术研究中心,郑州 450003)
基金项目:国家十二五科技支撑计划(2012BAD21B0502);国家公益性行业科研专项(201004029)
摘    要:为在转录水平解析杜仲叶片发育过程中的基因表达模式,该研究通过数字基因表达谱技术对‘华仲6号’杜仲叶片从展叶(4月)到落叶(10月)不同发育时期的基因表达水平进行比较分析,共获得差异基因3 002个,其中1 764个表达量上调,1 238个下调,这些差异表达基因主要行使催化、氧化还原等功能,参与代谢过程和生物过程等;进一步Pathway富集分析发现,苯丙素类生物合成途径相关基因被富集,其中调控绿原酸合成的6个基因差异表达显著;对这些基因表达模式进行分析显示,4月中旬和9月中旬基因的表达量较高,暗示这两个时期对于绿原酸的合成具有重要作用。荧光定量RT-PCR检测6个绿原酸合成相关基因和12个随机选择的差异表达基因,验证结果显示表达谱测序结果可靠。该研究结果为揭示杜仲叶片在不同发育时期的分子调控机制奠定了基础,并为深入解析杜仲绿原酸合成机理,进而通过分子育种手段提高杜仲绿原酸含量提供新的路径。

关 键 词:杜仲叶片  数字基因表达谱  差异基因  绿原酸

Analysis of Digital Gene Expression about Eucommia ulmoides Oliver Leaves at Different Developmental Stages
JING Teng,WANG Lin,WUYUN Tan,DU Hongyan. Analysis of Digital Gene Expression about Eucommia ulmoides Oliver Leaves at Different Developmental Stages[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2016, 36(2): 257-265
Authors:JING Teng  WANG Lin  WUYUN Tan  DU Hongyan
Abstract:
Keywords:Eucommia ulmoides Oliver leaf  digital gene expression profile  different expression gene  chlorogenic acid
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