首页
|
本学科首页
官方微博
|
高级检索
全部学科
医药、卫生
生物科学
工业技术
交通运输
航空、航天
环境科学、安全科学
自然科学总论
数理科学和化学
天文学、地球科学
农业科学
哲学、宗教
社会科学总论
政治、法律
军事
经济
历史、地理
语言、文字
文学
艺术
文化、科学、教育、体育
马列毛邓
全部专业
中文标题
英文标题
中文关键词
英文关键词
中文摘要
英文摘要
作者中文名
作者英文名
单位中文名
单位英文名
基金中文名
基金英文名
杂志中文名
杂志英文名
栏目中文名
栏目英文名
DOI
责任编辑
分类号
杂志ISSN号
Geometrical comparison of two protein structures using Wigner‐D functions
Authors:
S. M. Saberi Fathi
Diana T. White
Jack A. Tuszynski
Affiliation:
1. Department of Physics, Ferdowsi University of Mashhad, , Mashhad, Iran;2. Department of Oncology, University of Alberta, , Edmonton, Alberta, Canada;3. Department of Physics, University of Alberta, , Edmonton, Alberta, Canada
Abstract:
In this article, we develop a quantitative comparison method for two arbitrary protein structures. This method uses a root‐mean‐square deviation characterization and employs a series expansion of the protein's shape function in terms of the Wigner‐D functions to define a new criterion, which is called a “similarity value.” We further demonstrate that the expansion coefficients for the shape function obtained with the help of the Wigner‐D functions correspond to structure factors. Our method addresses the common problem of comparing two proteins with different numbers of atoms. We illustrate it with a worked example. Proteins 2014; 82:2756–2769. © 2014 Wiley Periodicals, Inc.
Keywords:
protein structure
protein classification
computational methods
Wigner‐D functions
root‐mean‐square deviation
tubulin
Fourier transform
reciprocal space
similarity value
correlation value
设为首页
|
免责声明
|
关于勤云
|
加入收藏
Copyright
©
北京勤云科技发展有限公司
京ICP备09084417号