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福建省输入性D8基因型麻疹病毒分子流行病学特征
引用本文:李东,杨秀惠,张苏晗,陈致飞,张海荣,潘伟毅,周勇.福建省输入性D8基因型麻疹病毒分子流行病学特征[J].病毒学报,2021,37(5):1066-1073.
作者姓名:李东  杨秀惠  张苏晗  陈致飞  张海荣  潘伟毅  周勇
作者单位:福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病重点实验室,福州350001;福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病重点实验室,福州350001;福建医科大学公共卫生学院教学基地,福州350001
摘    要:为分析福建省输入性D8基因型麻疹病毒分子流行病学特征,采集咽拭子标本采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)筛查麻疹病毒核酸.用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增麻疹病毒核酸筛查阳性咽拭子及Vero/Slam细胞培养阳性产物,对麻疹病毒核蛋白(Nucleoprotein,N)羧基(COOH)端634个核苷酸(Nucleotides,nt)片段进行测序分析,构建系统进化树.最终分离获得1株麻疹病毒株,26条麻疹病毒N蛋白羧基末端450个nt序列.亲缘性分析发现,所有福建麻疹毒株与WHOD8基因型参考株(MVi/Manchester.GBR/30.94)在亲缘关系树上同属一个大分支,两者核苷酸序列和氨基酸(Amino acid,aa)序列同源性分别为96.4%~99.1%和96.7%~98.0%.其中2014年的福建毒株 MVs/Fujian.CHN/28.14和 MVs/Fujian.CHN/30.14与越南胡志明市2014年分离株MVs/HoChiMinh.VNM/11.14及美国纽约2013年分离株MVs/New.York.USA/19.13的nt同源性为 100%;2019年的毒株MVs/Fujian.CHN/25.19与泰国龙仔厝府2018年分离株MVs/Samut.Sakhon.THA/8.18的nt同源性为100%;而剩余的23个监测毒株则与日本神户2019年分离株MVs/KobeC.JPN/28.19的核苷酸同源性和氨基酸同源性最高,分别为99.6%~100.0%和99.3%~100.0%.在病毒N蛋白羧基端150个氨基酸位点上,福建株与WHO D8参考株存在3~5个氨基酸位点差异.而与现用的疫苗株(Shanghai-191)相比,存在17~19个氨基酸变异位点,其中有14个氨基酸位点为所有福建株共有的变异位点,这些位点的变异总体上未对编码蛋白的氨基酸造成明显改变.结论是福建省成功分离获得1株D8基因型麻疹毒株.D8基因型为福建省发现的输入性麻疹基因型,病毒N蛋白羧基端氨基酸位点上与疫苗株相比均出现了差异位点.

关 键 词:麻疹病毒  输入性  D8基因型

Molecular Epidemiological Characteristics of Imported Measles Virus D8 Genotype Isolated in Fujian Province,China
LI Dong,YANG Xiuhui,ZHANG Suhan,CHEN Zhifei,ZHANG Hairong,PAN Weiyi,ZHOU Yong.Molecular Epidemiological Characteristics of Imported Measles Virus D8 Genotype Isolated in Fujian Province,China[J].Chinese Journal of Virology,2021,37(5):1066-1073.
Authors:LI Dong  YANG Xiuhui  ZHANG Suhan  CHEN Zhifei  ZHANG Hairong  PAN Weiyi  ZHOU Yong
Abstract:
Keywords:
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