| 靶向铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)粘肽合成酶PBP3的抗菌先导化合物的虚拟筛选及活性研究 |
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| 引用本文： | 喻召武,宋立华,童丽艳,王远,郑雯,宫兴文. 靶向铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)粘肽合成酶PBP3的抗菌先导化合物的虚拟筛选及活性研究[J]. 微生物学报, 2016, 56(2): 219-231 |
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| 作者姓名： | 喻召武 宋立华 童丽艳 王远 郑雯 宫兴文 |
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| 作者单位： | 浙江工商大学食品与生物工程学院, 浙江 杭州 310018,上海交通大学农业与生物学院, 上海 200240,浙江工商大学食品与生物工程学院, 浙江 杭州 310018,浙江工商大学食品与生物工程学院, 浙江 杭州 310018,浙江工商大学食品与生物工程学院, 浙江 杭州 310018,浙江工商大学食品与生物工程学院, 浙江 杭州 310018 |
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| 基金项目： | 浙江省自然科学基金(LY12C19011);食品科学与工程浙江省重中之重一级学科资助项目(JYTSP20141052) |
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| 摘 要： | 【目的】开发出与铜绿假单胞菌粘肽合成酶PBP3有高亲和力,具有全新结构的先导化合物。【方法】以铜绿假单胞菌粘肽合成酶PBP3为靶点,通过分子对接软件DOCK6.5,对含有104万个小分子化合物的数据库进行了大规模虚拟筛选,选取结构相对简单的中选化合物进行合成,得到先导化合物,并验证其抑菌活性。【结果】通过grid score进行第一轮初筛,筛选出grid score分值小于–30 kcal/mol的6万个化合物,接着以amber score进行第二轮筛选,筛出amber score分值小于–20 kcal/mol的化合物约200个。最终,经过观察分析,从中挑选出4种打分高并且结构新颖的小分子化合物作为先导化合物。合成出的先导化合物及其衍生物对铜绿假单胞菌等常见微生物的最小抑菌浓度(MIC)在175–275μg/m L之间,对革兰氏阴性菌和阳性菌均有效,MIC值比作为阳性对照的磺胺嘧啶更低,说明先导化合物具有较好的抗菌活性。【结论】这些先导化合物可以进一步开发为新型抗菌药物,用于解决铜绿假单胞菌的耐药性问题。
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| 关 键 词： | 铜绿假单胞菌 粘肽合成酶PBP3 耐药性 虚拟筛选 抑菌活性 |
| 收稿时间： | 2015-05-18 |
| 修稿时间： | 2015-07-13 |
Virtual screening and antibacterial activity of lead compounds targeting to penicillin-binding protein 3 (PBP3) of Pseudomonas aeruginosa |
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| Zhaowu Yu,Lihua Song,Liyan Tong,Yuan Wang,Wen Zheng and Xingwen Gong. Virtual screening and antibacterial activity of lead compounds targeting to penicillin-binding protein 3 (PBP3) of Pseudomonas aeruginosa[J]. Acta microbiologica Sinica, 2016, 56(2): 219-231 |
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| Authors: | Zhaowu Yu Lihua Song Liyan Tong Yuan Wang Wen Zheng Xingwen Gong |
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| Affiliation: | School of Food Science and Biotechnology, Zhejiang Gongshang University, Hangzhou 310018, Zhejiang Province, China,School of Agriculture and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China,School of Food Science and Biotechnology, Zhejiang Gongshang University, Hangzhou 310018, Zhejiang Province, China,School of Food Science and Biotechnology, Zhejiang Gongshang University, Hangzhou 310018, Zhejiang Province, China,School of Food Science and Biotechnology, Zhejiang Gongshang University, Hangzhou 310018, Zhejiang Province, China and School of Food Science and Biotechnology, Zhejiang Gongshang University, Hangzhou 310018, Zhejiang Province, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pseudomonas aeruginosa penicillin-binding protein 3 drug resistance virtual screening antibacterial activity |
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