| 青石斑鱼海水循环水养殖水体的细菌群落特征北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 侯婷婷,钟志平,刘缨,刘志培.青石斑鱼海水循环水养殖水体的细菌群落特征北大核心CSCD[J].微生物学报,2016,56(2):253-263. |
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| 作者姓名： | 侯婷婷 钟志平 刘缨 刘志培 |
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| 作者单位： | 中国科学院微生物研究所, 微生物资源前期开发国家重点实验室, 北京 100101;中国科学院大学生命科学院, 北京 100049,中国科学院微生物研究所, 微生物资源前期开发国家重点实验室, 北京 100101;中国科学院大学生命科学院, 北京 100049,中国科学院微生物研究所, 微生物资源前期开发国家重点实验室, 北京 100101,中国科学院微生物研究所, 微生物资源前期开发国家重点实验室, 北京 100101 |
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| 基金项目： | 山东省自主创新工程项目(2014ZZCX06204);中国科学院创新工程项目(KZCX2-EW-Q212) |
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| 摘 要： | 【目的】为揭示工厂化循环水青石斑鱼养殖水体的细菌群落特征,比较患病养殖池与健康养殖池的细菌群落结构差异,探讨细菌群落结构与青石斑鱼病害相关的相关性。【方法】采用Illumina Miseq高通量测序方法,分析比较了患病和健康养殖水体细菌群落结构、α-多样性指数(包括多度、均一度和系统发育多样性);并结合传统方法从患病青石斑鱼病灶部位分离疑似病原菌。【结果】患病和健康养殖水体中细菌群落的α-多样性并无太大差异,但主坐标分析与热图样本聚类分析表明细菌群落结构明显不同。二者的优势细菌门均为Proteobacteria、Verrucomicrobia和Bacteroidetes,但它们的相对丰度差异显著。患病养殖水体中α-Proteobacteria(25.07%)和γ-Protebacteria(22.74%)丰度相当,而健康养殖水体中γ-Protebacteria(40.49%)显著高于α-Proteobacteria(10.87%)。患病水体的Verrucomicrobia丰度(26.4%)远高于健康水体(10.9%);而Bacteroidetes的相对丰度则相反(12.3%vs 20.9%)。主要的差异类群包括α-Proteobacteria的Rhodobacteraceae和Rhodospirillaceae,γ-Proteobacteria的Alteromonadaceae、HTCC2188和Oceanospirillaceae,Verrucomicrobia的Verrucomicrobiaceae和Bacteroidetes的Cryomorphaceae。更表现在核心微生物类群的差异,健康养殖池水体以Glaciecola、HTCC、Sediminicola、Prevotella等对于养殖动物有益或无害的属为核心微生物;而患病养殖池水体则以Vibrio、Rubritalea、Oleibacter等病原菌或对养殖动物不利的属为核心微生物。从患病青石斑鱼的皮肤、肝脏和脾脏共分离得到弧菌20株,Acinetobacter haemolyticus 1株。【结论】患病的青石斑鱼循环水养殖水体中的细菌群落明显不同于健康养殖水体,特别是核心微生物的差异,其以Vibrio等病原菌或对养殖动物不利的属为主。该结果为青石斑鱼循环水养殖系统的管理、病害的诊断和监测提供理论与实验基础。
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| 关 键 词： | 青石斑鱼 循环水养殖系统 养殖水体 细菌群落 核心微生物 |
| 收稿时间： | 2015/5/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/6/24 0:00:00 |
Bacterial community characterization of rearing water of marine recirculating aquaculture systems for yellow grouper (Epinephelus awoara) |
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| Tingting Hou,Zhiping Zhong,Ying Liu and Zhipei Liu.Bacterial community characterization of rearing water of marine recirculating aquaculture systems for yellow grouper (Epinephelus awoara)[J].Acta Microbiologica Sinica,2016,56(2):253-263. |
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| Authors: | Tingting Hou Zhiping Zhong Ying Liu and Zhipei Liu |
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| Institution: | State Key Laboratory of Microbial Resources, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;College of Life Sciences, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,State Key Laboratory of Microbial Resources, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;College of Life Sciences, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,State Key Laboratory of Microbial Resources, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China and State Key Laboratory of Microbial Resources, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Yellow grouper (Epinephelus awoara) recirculating aquaculture system (RAS) rearing water bacterial community core microbes |
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