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菜心SOD基因的克隆及其在低温条件下的表达分析
引用本文:曾小玲,赵瑞丽,钟开勤,朱朝辉,陈敏氡.菜心SOD基因的克隆及其在低温条件下的表达分析[J].西北植物学报,2019,39(2):218-225.
作者姓名:曾小玲  赵瑞丽  钟开勤  朱朝辉  陈敏氡
作者单位:福州市蔬菜科学研究所;福建省农业科学研究院作物研究所
基金项目:福州市重大专项(2016Z0001);
摘    要:采用同源克隆法从菜心中获得3个SOD基因,并进行生物信息学分析,采用qRT-PCR分析3个基因在不同组织器官和低温胁迫下的表达模式。结果表明:(1)获得Cu/Zn-SOD、Fe-SOD、Mn-SOD基因的ORF,分别命名为BclCZSD、BclFSD、BclMSD,序列长分别为459、639、696bp,分别编码152、212、231个氨基酸。(2)生物信息学分析显示,3种蛋白均为稳定的亲水性蛋白,均不存在跨膜结构和信号肽,BclCZSD的二级结构以无规则卷曲为主,含有2个Cu/Zn-SOD结构域,BclFSD和BclMSD的二级结构以α-螺旋为主,含有一个相同的Mn/Fe-SOD结构域;进化分析显示BclCZSD和BclMSD与油菜最先聚在一个分支,BclFSD与甘蓝、萝卜、油菜、芜菁聚在一个分支。(3)qRT-PCR结果显示,BclCZSD、BclFSD和BclMSD基因在菜心根、茎、叶和叶柄中均有表达,且在根、茎、叶和叶柄中的表达模式不完全相同;低温条件下,3个基因的表达量随着胁迫时间的延长均呈先升高后降低的变化趋势。研究结果为进一步探讨菜心SOD基因在低温胁迫下的响应机制奠定了基础。

关 键 词:菜心  BclCZSD  BclMSD  BclFSD  低温胁迫  表达分析

Cloning and Expression Analysis of SOD Genes of Brassica campestris L. ssp. chinensis(L.) var. utilis Tsen et Lee under Low Temperature
ZENG Xiaoling,ZHAO Ruili,ZHONG Kaiqin,ZHU Chaohui,CHEN Mindong.Cloning and Expression Analysis of SOD Genes of Brassica campestris L. ssp. chinensis(L.) var. utilis Tsen et Lee under Low Temperature[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2019,39(2):218-225.
Authors:ZENG Xiaoling  ZHAO Ruili  ZHONG Kaiqin  ZHU Chaohui  CHEN Mindong
Abstract:
Keywords:
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