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人类基因组单核苷酸多态性和单体型的分析及应用
引用本文:李婧,潘玉春,李亦学,石铁流.人类基因组单核苷酸多态性和单体型的分析及应用[J].遗传学报,2005,32(8):879-889.
作者姓名:李婧  潘玉春  李亦学  石铁流
作者单位:1. 上海交通大学生命科学技术学院,上海,200030
2. 上海交通大学生物与农业学院,上海,201101
3. 中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心,上海,200031
4. 中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心,上海,200031;上海大学生物信息学中心,上海,200436
基金项目:国家高技术研究发展计划项目(国家“863计划”)(编号:2002AA231051,2001AA231011,2001AA231111)
摘    要:单核苷酸多态性是人类基因组中最丰富的遗传变异。单体型是指位于一条染色体上或某一区域的一组相关联的SNP等位位点,单体型已经成为近年来人类遗传研究的组成部分。人类基因组单体型图(HapMap)计划的目标就是构建人类DNA序列中多态位点的常见模式,找出代表整个人类基因图谱之中的SNP集合的标签SNP。在复杂性疾病研究中,由多个变异位点组合构成的单体型分析优于单个SNP的分析。文章论述了SNPs、基因型、表现型的定义与HapMap计划的一些情况,综述了单体型的3种推断算法和单体域的不同定义与构建方法,同时介绍了标签SNP的选择及单体型与复杂疾病关联分析的方法,可利用公共SNP数据库的情况以及SNPs与单体型在复杂疾病与药物反应方面的应用。

关 键 词:SNPs  单体型  单体域  标签SNPs  复杂性疾病
文章编号:0379-4172(2005)08-0879-11
收稿时间:2004-10-13
修稿时间:2004-10-13

Analysis and Application of SNP and Haplotype in the Human Genome
LI Jing,PAN Yu-Chun,LI Yi-Xue,SHI Tie-Liu.Analysis and Application of SNP and Haplotype in the Human Genome[J].Journal of Genetics and Genomics,2005,32(8):879-889.
Authors:LI Jing  PAN Yu-Chun  LI Yi-Xue  SHI Tie-Liu
Abstract:
Keywords:SNPs  haplotype  haplotype block  tag SNPs  complex disease
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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