| 一种MicroRNA duplex设计新技术研究 |
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| 引用本文： | 周珏宇,马文丽,丁大鹏,石嵘,郑文岭.一种MicroRNA duplex设计新技术研究[J].生命科学研究,2006,10(2):109-112. |
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| 作者姓名： | 周珏宇 马文丽 丁大鹏 石嵘 郑文岭 |
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| 作者单位： | 南方医科大学,基因工程研究所,中国,广东,广州,510515;华南基因组研究中心,中国,广东,广州,510800 |
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| 基金项目： | 广东省重点实验室建设经费资助项目(2004B60144)，广东省自然科学基金博士启动项目(5300488) |
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| 摘 要： | 利用microRNA数据库,获取3种微RNAmir-181a、mir-124和mir-1的成熟序列信息.基于siRNAdu-plex在形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-inducedsilencingcomplex,RISC)过程中的不对称性的特点,初步设计了针对上述3种微RNA的microRNAduplex.采用生物学软件Oligo6.0分别评价其热动力学特性,并通过改变反义链3'端个别碱基序列使其满足热动力学的需求,从而确定最终的设计序列.结果显示,利用RISC形成过程的不对称性,结合生物学软件Oligo6.0的热动力学分析来设计miRNAduplex,是一种简便可行、准确有效的方法.
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| 关 键 词： | 微RNA siRNA 生物信息学分析 热动力学性质 |
| 文章编号： | 1007-7847（2006）02-0109-04 |
| 收稿时间： | 2005-12-12 |
| 修稿时间： | 2006-03-08 |
A New Method of MicroRNA Duplex Design and Analysis |
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| ZHOU Jue-yu,MA Wen-li,DING Da-peng,SHI Rong,ZHENG Wen-ling.A New Method of MicroRNA Duplex Design and Analysis[J].Life Science Research,2006,10(2):109-112. |
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| Authors: | ZHOU Jue-yu MA Wen-li DING Da-peng SHI Rong ZHENG Wen-ling |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | microRNA(miRNA) siRNA bioinformatic analysis thermodynamic characterization |
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