| 1株表现为鞭毛抗原3相的韦太夫雷登沙门氏菌的鉴定和基因组序列分析 |
| |
| 引用本文： | 曾婷婷,谢芝勋,谢丽基,刘加波,罗思思,张艳芳,范晴,黄娇玲,张民秀,王盛,邓显文,谢志勤.1株表现为鞭毛抗原3相的韦太夫雷登沙门氏菌的鉴定和基因组序列分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(1):216-223. |
| |
| 作者姓名： | 曾婷婷 谢芝勋 谢丽基 刘加波 罗思思 张艳芳 范晴 黄娇玲 张民秀 王盛 邓显文 谢志勤 |
| |
| 作者单位： | 广西壮族自治区兽医研究所,南宁,530001 |
| |
| 摘 要： | 利用高通量测序获取1株抗原式为3,10∶a,r,z6的沙门氏菌(Salmonella)GX150603的全基因组序列.根据鞭毛抗原序列、致病性和抗性基因预测GX150603的血清型,利用分子生物学软件分析基因组岛和前噬菌体,并与其他菌株进行全基因组系统发育分析.经鉴定GX150603为韦太夫雷登沙门氏菌(Salmonella enteric asubsp.enterica serovar Weltevreden),并推测由于鞭毛抗原的氨基酸变异导致该菌株与H∶a血清产生了交叉反应.GX150603基因组携带148个毒力相关基因,8个耐药相关基因,27个基因组岛和3个前噬菌体.基因组岛包括沙门氏菌毒力岛SPI-1/2/3/4/5/6/9/11/13/14/19,centisome 63,CS54和3个该血清型特有的基因组岛.与7个韦太夫雷登沙门氏菌欧洲分离株比较,GX150603有4个共线性片段重排,4个共线性片段缺失和1个共线性片段存在较大差异,进化分析显示,同一血清型仍然表现出最近的亲缘关系.
|
| 关 键 词： | 韦太夫雷登沙门氏菌 全基因组测序 基因组岛 基因组比对 |
Genomic Sequence Analysis of a Salmonella enterica subsp.enterica serovar Weltevreden Strain with Triphasic Serovar |
| |
| Zeng Tingting,Xie Zhixun,Xie Liji,Liu Jiabo,Luo Sisi,Zhang Yanfang,Fan Qing,Huang Jiaol-ing,Zhang Minxiu,Wang Sheng,Deng Xianwen,Xie Zhiqin.Genomic Sequence Analysis of a Salmonella enterica subsp.enterica serovar Weltevreden Strain with Triphasic Serovar[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(1):216-223. |
| |
| Authors: | Zeng Tingting Xie Zhixun Xie Liji Liu Jiabo Luo Sisi Zhang Yanfang Fan Qing Huang Jiaol-ing Zhang Minxiu Wang Sheng Deng Xianwen Xie Zhiqin |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
