烟草幼苗响应弱光胁迫的转录组分析 |
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引用本文: | 关晓溪,隋常玲,陈瑶,周纯.烟草幼苗响应弱光胁迫的转录组分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(1):315-324. |
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作者姓名: | 关晓溪 隋常玲 陈瑶 周纯 |
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作者单位: | 遵义师范学院生物与农业科技学院,遵义,563000;遵义市第一人民医院,遵义,563000 |
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摘 要: | 为了研究烟草幼苗对弱光胁迫反应的分子机制,以'云烟87'为材料,构建全光照和弱光处理条件下大十字期烟苗cDNA文库,利用Illumina测序技术进行转录组测序,筛选差异表达基因.结果表明:借助RNA-seq技术共筛选到2 956个DEGs,其中弱光相对于全光照表达上调的DEGs有691个,表达下调的DEGs为2 265个;通过GO功能分类和KEGG富集分析,将差异基因划分为30个功能类别和113个代谢途径,包括代谢进程、碳水化合物结合、核酸结合转录因子活性、水解酶活性、转录因子活性、催化活性、内质网蛋白质加工、植物-病原体互作、苯丙烷生物合成、苯丙氨酸代谢、胁迫反应、激素信号转导以及光合作用等.本研究将为揭示烟草对弱光胁迫反应的分子机制提供理论依据.
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关 键 词: | 烟草(Nicotiana tabacum L.) 弱光胁迫 大十字期 转录组 |
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