| 基于GEO数据库、TMT蛋白组学筛选绞股蓝对膀胱癌的蛋白靶点 |
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| 引用本文： | 常拓,齐彦爽,蔺曼,朴香兰. 基于GEO数据库、TMT蛋白组学筛选绞股蓝对膀胱癌的蛋白靶点[J]. 基因组学与应用生物学, 2021, 40(3): 1331-1338. DOI: 10.13417/j.gab.040.001331 |
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| 作者姓名： | 常拓 齐彦爽 蔺曼 朴香兰 |
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| 作者单位： | 中央民族大学药学院,北京,100081 |
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| 摘 要： | 绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum)是传统的中药材,对于多种癌症具有显著的疗效.为筛选绞股蓝对膀胱癌的作用靶点,本研究将30只SPF级SD大鼠随机分为模型组、给药组和空白组,通过膀胱灌注N-甲基-N-亚硝基脲(MNU)建立膀胱癌模型并通过相同的方式进行膀胱灌注绞股蓝干预治疗,在第10周进行取材,通过H&E染色病理切片观察各组膀胱内肿瘤情况以明确药效.通过蛋白质组学串联质谱标签(TMT) 10重标记法检测各组膀胱组织的蛋白差异表达情况,结合GEO数据库中3组膀胱癌数据集对作用靶点进行筛选.结果 显示,绞股蓝反向调节膀胱癌335种蛋白质,其中包括55种上调和280种下调.GEO的3个膀胱癌表达谱中汇集的差异蛋白(DEGs)包含20种上调和50种下调.将GEO中DEGs与TMT蛋白质组学中膀胱癌趋势相同的蛋白进行汇集,结合绞股蓝反向调节数据,总共筛选获得了3个反向调节靶点,其中包括1种下调的靶点CNN1和2种上调的靶点KRT19、PCP4,并通过蛋白免疫印迹法进行验证.本研究结果表明,CNN1、KRT19和PCP4可能是绞股蓝治疗膀胱癌的潜在靶点,绞股蓝可能通过调节CNN1、KRT19和PCP4来抵抗膀胱癌,这为绞股蓝治疗膀胱癌提供分子机制依据.
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| 关 键 词： | 膀胱癌 绞股蓝 CNN KRT19 PCP4 |
Screening Protein Targets of Gynostemma pentaphyllum on Bladder Cancer Based on GEO Database and TMT Proteomics |
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| Chang Tuo,Qi Yanshuang,Lin Man,Piao Xianglan. Screening Protein Targets of Gynostemma pentaphyllum on Bladder Cancer Based on GEO Database and TMT Proteomics[J]. Genomics and Applied Biology, 2021, 40(3): 1331-1338. DOI: 10.13417/j.gab.040.001331 |
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| Authors: | Chang Tuo Qi Yanshuang Lin Man Piao Xianglan |
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