| 十字花科黑腐病菌中存在tRNA衍生片段(tRF)的证据 |
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| 引用本文： | 刘金阳,黄小英,陈妍妙,唐东阶.十字花科黑腐病菌中存在tRNA衍生片段(tRF)的证据[J].基因组学与应用生物学,2021,40(1):264-269. |
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| 作者姓名： | 刘金阳 黄小英 陈妍妙 唐东阶 |
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| 作者单位： | 广西大学生命科学与技术学院,南宁,530005;广西大学生命科学与技术学院,南宁,530005;亚热带农业生物资源保护利用国家重点实验室,南宁,530005 |
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| 摘 要： | tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)是一种由内切核糖核酸酶将初级tRNA(primary tRNA)或成熟tRNA分子剪切后形成的长度为14～30 nt(核苷酸)的稳定的RNA片段.研究表明,tRF广泛存在于各种真核生物中,它们既可以作为信号分子,又可以作为基因表达的调控因子,在细胞的各种生理过程中发挥重要的调控作用.但至今除了在大肠杆菌(Escherichia coli)和沃氏富盐菌(Haloferax volcanii)中发现了 tRF外,在其他原核生物中未见有关tRF的报道.本研究采用高灵敏度的Northern杂交技术对十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)的苏氨酸-tRNA(threonine-tRNA,tRNAThr)和甲硫氨-tRNA(me-thionine-tRNA,tRNAMet)进行了检测.结果显示,除了检测到全长的成熟tRNAThr 和tRNAMet外,还检测到多个丰度各异的稳定的tRF,而且一些tRF的产生受营养胁迫的诱导.此外,我们还发现,编码tRNAMet的基因XC4381已经退化为非编码RNA基因.本研究证明了 tRF在Xcc中的存在,为深入研究tRF的功能,特别是在Xcc致病中的作用奠定了基础.
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| 关 键 词： | 十字花科黑腐病菌 tRNA衍生片段 高灵敏度Northern杂交 tRNA基因退化 |
The Evidence that tRNA-derived Fragment(tRF)Existed in Xanthomonas campestris pathovar campestris |
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| Liu Jinyang,Huang Xiaoying,Chen Yanmiao,Tang Dongjie.The Evidence that tRNA-derived Fragment(tRF)Existed in Xanthomonas campestris pathovar campestris[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(1):264-269. |
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| Authors: | Liu Jinyang Huang Xiaoying Chen Yanmiao Tang Dongjie |
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