| 高浓度氧或HCl处理条件下家蚕胚胎早期比较转录组分析 |
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| 引用本文： | 龚竞,杨领振,郑茜,唐苗,颜瑞丰,朱勇.高浓度氧或HCl处理条件下家蚕胚胎早期比较转录组分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(1):60-71. |
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| 作者姓名： | 龚竞 杨领振 郑茜 唐苗 颜瑞丰 朱勇 |
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| 作者单位： | 农业农村部蚕桑生物学与遗传育种重点实验室,重庆,400715;西南大学蚕桑纺织与生物质科学学院,重庆,400715;西南大学蚕桑纺织与生物质科学学院,重庆,400715;西南大学西塔学院,重庆,400715 |
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| 摘 要： | 本研究以阐明阻断蚕卵滞育机制为目标,通过获得连续时间点的转录组数据,深入解析滞育过程的分子变化.采用高通量测序技术对高浓度氧、HC1处理的滞育蚕卵(以下简称"处理组")和未处理的对照组,在产后26 h、32 h和44h取样进行转录组测序,在产后26 h到32h阶段,处理组和对照组的共同差异基因(DE-Gs)233个,占整个数量的44.5％;32 h到44 h的阶段,处理组和对照组共同DEGs仅16个,占整体数量的6.7％,但是此时处理组的共同DEGs为93个,占整体数量的38.9％.进一步对筛选的DEGs进行GO和KEGG通路分析,GO分析表明DEGs在处理组中在氧化还原功能上得到了显著富集,但是在对照组中没有得到显著富集;KEGG分析发现在产后26 h到32 h,处理组和对照组的DEGs都在溶酶体等代谢通路上调富集,但在产后32 h到44 h,处理组的蚕卵代谢通路变化相似,都在甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸等代谢通路富集,而对照组在精氨酸和脯氨酸等代谢通路富集.综上,在产后初期,发育时间对蚕卵发育的影响大于处理的影响,然而到了后期处理的影响则逐渐突显.
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| 关 键 词： | 家蚕 滞育 高浓度氧 HC1 转录组 |
RNA-seq Analysis of Silkworm Eggs in the Early Stage of Diapause Bloc-king with the Treatment of Hyperoxia and HCl |
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| Gong Jing,Yang Lingzhen,Zheng Xi,Tang Miao,Yan Ruifeng,Zhu Yong.RNA-seq Analysis of Silkworm Eggs in the Early Stage of Diapause Bloc-king with the Treatment of Hyperoxia and HCl[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(1):60-71. |
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| Authors: | Gong Jing Yang Lingzhen Zheng Xi Tang Miao Yan Ruifeng Zhu Yong |
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