| 裂解褐藻胶海洋微生物的分离筛选及其功能基因进化分析 |
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| 引用本文： | 陈思,陈星,姜宫凌侠,赵华显,唐金利,徐强胜,李楠,蒋承建.裂解褐藻胶海洋微生物的分离筛选及其功能基因进化分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(3):1141-1149. |
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| 作者姓名： | 陈思 陈星 姜宫凌侠 赵华显 唐金利 徐强胜 李楠 蒋承建 |
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| 作者单位： | 广西大学生命科学与技术学院,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁,530004;广西大学生命科学与技术学院,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁,530004;南宁师范大学,北部湾环境演变与资源利用教育部重点实验室,南宁,530001;南宁师范大学,北部湾环境演变与资源利用教育部重点实验室,南宁,530001 |
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| 摘 要： | 本研究以褐藻酸钠为唯一碳源,从广西茅尾海采集的海藻和海水样品中分离获得了10株高产褐藻胶裂解酶(Alginate lyase)的菌株,经过16S rDNA系统发育分析,初步确定这些菌株分别属于盐单胞菌属、假交替单胞菌属和弧菌属.为进一步了解褐藻胶裂解酶(ALG)功能基因的进化轨迹,本研究从GenBank收集了alg基因的同源序列.通过系统发育分析和极大似然分析,运行位点模型和分支位点模型进行了计算,确定该基因存在正选择现象.正选择进化分析结果表明4Y、16I、40N、61L、91T、99S、149L和154S为alg基因的正选择位点,提示环境选择压力促进了alg基因的进化.本研究为后续褐藻胶裂解酶定向诱变或残基的结构与功能之间的作用机制等相关研究提供重要的科学依据和理论支撑.
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| 关 键 词： | 褐藻胶 海洋微生物 分离筛选 功能基因 进化分析 |
Isolation,Screening and Functional Gene Evolution Analysis of Alginate Lysing Marine Microorganisms |
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| Chen Si,Chen Xing,Jiang Gonglingxia,Zhao Huaxian,Tang Jinli,Xu Qiangsheng,Li Nan,Jiang Chengjian.Isolation,Screening and Functional Gene Evolution Analysis of Alginate Lysing Marine Microorganisms[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(3):1141-1149. |
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| Authors: | Chen Si Chen Xing Jiang Gonglingxia Zhao Huaxian Tang Jinli Xu Qiangsheng Li Nan Jiang Chengjian |
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