| 中国南部地区蜘蛛兰上朱顶红褪绿环斑病毒RNAL序列分析 |
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| 引用本文： | 李慧芳,高君直,贾志强,桂敏,刘雅婷,李永忠. 中国南部地区蜘蛛兰上朱顶红褪绿环斑病毒RNAL序列分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2021, 40(4): 1694-1701. DOI: 10.13417/j.gab.040.001694 |
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| 作者姓名： | 李慧芳 高君直 贾志强 桂敏 刘雅婷 李永忠 |
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| 作者单位： | 云南农业大学农学与生物技术学院,昆明,650201;云南农业大学植物保护学院,昆明,650201;云南农业大学烟草学院,昆明,650201 |
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| 摘 要： | 朱顶红褪绿环斑病毒(Hippeastrum chlorotic ringspot virus,HCRV)流行和扩张速度极快,严重危害多种蔬菜和花卉产业,造成严重的经济损失,己上升成为中国南部地区正番茄斑萎病毒属(Orthotospovirus)优势种.对不同地区HCRV分离株进行克隆,研究其在不同地区快速扩张和进化的机制对农业发展具有重要意义.本研究对2013-2015年在云南、广东、广西、福建和海南等5个中国南部地区采集的疑似感染Orthoto-spovirus属病毒的蜘蛛兰样本,采用RT-PCR技术鉴定、分离,得到10份HCRV新分离株,对其L序列进行克隆、测序.结合现有分离株,利用DNAMAN 7.0和MEGA 7.0进行分子多样性、系统发育和重组分析.结果显示,本研究的10份HCRV L分离株,包括1个最早报道的HCRV HLS1-2L分离株,可分为2个不同来源的类群.结合10份分离株采集地的环境信息,对比可看出其气候、温度、降水等差异很大,推测HCRV在中国南部地区的广泛分布与不同地区多态的气候类型有关,在它们的进化过程中,突变和重组发挥作用.RdRp是参与HCRV在细胞内的复制和转录的重要蛋白,对RdRp序列的分析,可为后续研究HCRV RdRp的遗传变异对HCRV侵染能力的影响提供理论基础,也为HCRV的防治提供思路.
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| 关 键 词： | 朱顶红褪绿环斑病毒 蜘蛛兰 系统发育分析 突变 重组 |
L RNA Analysis of Hippeastrum Chlorotic Ringspot Virus on Spider Lily in Southern China |
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| Li Huifang,Gao Junzhi,Jia Zhiqiang,Gui Min,Liu Yating,Li Yongzhong. L RNA Analysis of Hippeastrum Chlorotic Ringspot Virus on Spider Lily in Southern China[J]. Genomics and Applied Biology, 2021, 40(4): 1694-1701. DOI: 10.13417/j.gab.040.001694 |
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| Authors: | Li Huifang Gao Junzhi Jia Zhiqiang Gui Min Liu Yating Li Yongzhong |
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