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正交设计优化北重楼ISSR-PCR体系
引用本文:张龙进,白成科. 正交设计优化北重楼ISSR-PCR体系[J]. 植物研究, 2011, 31(1): 105-108
作者姓名:张龙进  白成科
作者单位:1.陕西师范大学生命科学学院,西安 710062;;2.西北濒危药材资源开发国家工程实验室,西安 710062
基金项目:中央高校基本科研业务费项目(GK261001); 陕西生省科技计划项目(2007K16-03); 西安市科技计划项目(YF07112)资助
摘    要:利用正交试验设计L9(34)的方法,最终建立了北重楼ISSR-PCR的优化反应体系,即20 μL反应体系中包含1×buffer,dNTP 175 μmol·L-1,Primer 0.8 μmol·L-1,Mg2+ 1.4 mmol·L-1Taq酶2.5 U及模板DNA 80 ng。适宜的扩增程序为95℃预变性5 min;94℃变性40 sec,55℃退火45 sec,72℃延伸90 sec,40个循环;72℃延伸7 min,4℃保存。该优化体系的建立,将为北重楼及其近缘种的系统学和种质资源鉴定及遗传多样性的研究奠定基础。

关 键 词:北重楼;ISSR-PCR;分子标记;正交优化

Optimization of ISSR-PCR System for Paris vertcillata
ZHANG Long-Jin BAI Cheng-Ke. Optimization of ISSR-PCR System for Paris vertcillata[J]. Bulletin of Botanical Research, 2011, 31(1): 105-108
Authors:ZHANG Long-Jin BAI Cheng-Ke
Affiliation:ZHANG Long-Jin1 BAI Cheng-Ke1,2(1.College of Life Sciences,Shaanxi Normal University,Xi'an 710062,2.National Engineering laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs in Northwest of China,Xi'an 710062)
Abstract:The optimal ISSR-PCR system for Paris vertcillata was established with orthogonal design.A total of 20 μL ISSR-PCR system contains 1×buffer, dNTP 175 μmol·L-1,Primer 0.6 μmol·L-1,Mg2+ 1.4 mmol·L-1Taq DNA polymerase 2.5 U and 80 ng template DNA.The suitable PCR procedure is one cycle denaturing at 95℃ for 5 min;40 cycles each involved denaturing at 94℃for 40 s,annealing at 55℃ for 45 s,extending at 72℃ for 90 s,one cycle extending at 72℃ for 7 min,and then remaining at 4℃.This optimized system would play an important role in further research of systematology on P.vertcillata and its related species, as well as identification on germplasm, and genetic diversity by ISSR molecular marker.
Keywords:Paris vertcillata  ISSR-PCR  molecular markers  orthogonal optimization
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