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乙脑病毒持续感染株preM区序列分析
引用本文:徐可树,李琪,王华枫,周霞.乙脑病毒持续感染株preM区序列分析[J].中国病毒学,2006,21(4):309-313.
作者姓名:徐可树  李琪  王华枫  周霞
作者单位:徐可树(华中科技大学同济医学院附属协和医院消化内科,武汉,430022)       李琪(华中科技大学同济医学院附属协和医院消化内科,武汉,430022)       王华枫(华中科技大学同济医学院附属协和医院消化内科,武汉,430022)       周霞(华中科技大学同济医学院附属协和医院消化内科,武汉,430022)
摘    要:为了研究乙型脑炎病毒持续感染株preM区域基因序列变异及其意义,我们将两种乙脑病毒野生株(JaGAr-01株和Nakayama株)分别感染人肝癌KN73细胞,经过多次细胞传代后建立乙脑病毒持续感染模型,收集感染细胞经反复冻融获取变异病毒.利用preM区特异引物进行RT-PCR法得到两种病毒的preM区基因片段,应用基因测序反应进行序列分析,并对两种病毒株preM区序列进行比较.preM区基因测序结果显示,与JaGAr-01野生株比较,JaGAr-01持续感染变异株(JaG-per)有1个核苷酸上碱基发生变异(第26位U→G)并导致相应氨基酸发生置换(第9位亮氨酸→精氨酸);Nakayama持续感染变异株(Nak-per)与其野生株相比则有11个核苷酸上碱基存在差异(第26位U→G,第37位G→A,第39位C→U,第45位U→C,第51位U→C,第99位U→C,第126位U→C,第165位C→U,第189位C→U,第195位C→U,第198位U→C),但仅有其中第26位、第37位、第39位的碱基变异引起相应编码的氨基酸发生置换(第9位亮氨酸→精氨酸及第13位缬氨酸→异亮氨酸).对比还发现变异后的JaGAr-01持续感染株与Nakayama持续感染株的基因序列相同.认为乙脑病毒持续感染变异株preM区存在基因变异,这种变异可能与该区参与病毒持续感染及维持病毒生物学特性有关.

关 键 词:流行性乙型脑炎病毒  持续感染  preM区序列分析  基因变异
文章编号:1003-5125(2006)04-0309-05
修稿时间:2005年12月2日

Significance and preM Sequence Analysis of Different Mutant Japanese Encephalitis Virus Strains in Persistently Infected KN73 Cells
XU Ke-shu,LI Qi,WANG Hua-feng,ZHOU Xia.Significance and preM Sequence Analysis of Different Mutant Japanese Encephalitis Virus Strains in Persistently Infected KN73 Cells[J].Virologica Sinica,2006,21(4):309-313.
Authors:XU Ke-shu  LI Qi  WANG Hua-feng  ZHOU Xia
Institution:1.Department of Digestive Disease,Union Hospital of Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430022,China
Abstract:
Keywords:Japanese encephalitis virus (JEV)  Persistent infection  preM sequence analysis  Genovariation
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