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基于单拷贝核基因的褐沙蒿遗传结构和谱系地理学分析
引用本文:唐思如,王铁娟,秀芳,刘梦瑶,张慧.基于单拷贝核基因的褐沙蒿遗传结构和谱系地理学分析[J].植物研究,2022,42(6):956-963.
作者姓名:唐思如  王铁娟  秀芳  刘梦瑶  张慧
作者单位:内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古自治区高等学校生物多样性保护与可持续利用重点实验室,呼和浩特 010022
基金项目:内蒙古自治区自然科学基金项目(2019MS03041)
摘    要:褐沙蒿(Artemisia intramongolica)是我国浑善达克沙地重要的固沙植物。本研究利用转录组测序开发获得的直系同源单拷贝核基因c9065c7847对褐沙蒿8个自然种群进行群体遗传结构与谱系地理特征研究。结果表明:c9065c7847总长度分别为485、457 bp,具有14、19个变异位点,分别获得48、40种单倍型;褐沙蒿单倍型多样性Hd分别为0.871 6和0.934 8,各种群均在0.8以上;总核苷酸多样性π分别为0.008 2和0.005 9,各种群均在0.005以上,表明不论是种还是种群均有高的遗传多样性。AMOVA分析结果显示,基于c9065c7847,褐沙蒿分别有99.398%和98.908%的遗传变异存在于种群内,基因流Nm分别为6.810和7.270,远远大于1,说明褐沙蒿种群间基因交流十分广泛。c9065的分析结果Nststc7847虽然Nst>Gst,但差异不显著(P>0.05),说明褐沙蒿种群不存在明显的谱系地理结构。中性检验显示,2个核基因的Tajima’s D值均不显著(P>0.05),而Fu’s Fs值显著(P<0.05),结合歧点分布分析,反映出褐沙蒿在中性模式下经历有限的种群扩张。

关 键 词:褐沙蒿  单拷贝核基因  遗传结构  谱系地理  
收稿时间:2022-02-15

Genetic Structure and Phylogeography Analysis of Artemisia intramongolica Based on Single Copy Nuclear Genes
Siru TANG,Tiejuan WANG,Fang XIU,Mengyao LIU,Hui ZHANG.Genetic Structure and Phylogeography Analysis of Artemisia intramongolica Based on Single Copy Nuclear Genes[J].Bulletin of Botanical Research,2022,42(6):956-963.
Authors:Siru TANG  Tiejuan WANG  Fang XIU  Mengyao LIU  Hui ZHANG
Institution:College of Life Sciences and Technology,Inner Mongolia Normal University,Key Laboratory of Biodiversity Conservation and Sustainable Utilization for College and University of Inner Mongolia Autonomous Region,Hohhot 010022
Abstract:
Keywords:Artemisia intramongolica  single-copy nuclear genes  genetic structure  phylogeography  
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